RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C BMH1P29311 267 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C UTR5P32630 166 aa1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YAR1P46683 200 aa1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C NIF3P53081 288 aa1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C SLX9P53251 210 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C SYF2P53277 215 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C EBS1Q03466 884 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C MIX17Q03667 156 aa1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C PEX10Q05568 337 aa1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C DAL82P21705 255 aa1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C TOM40P23644 387 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RRT12P25381 491 aa1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C COY1P34237 679 aa1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RPL10P41805 221 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data1.16□□□□□ -2.22not detected
HDA3YPR179C ADH6Q04894 360 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C CTS2Q06350 511 aa1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C BTS1Q12051 335 aa1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YOL107WQ12239 342 aa1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C AGC1Q12482 902 aa1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C YPL119C-AQ3E751 87 aa1.16□□□□□ -2.22
HDA3YPR179C RAD10P06838 210 aa1.15□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RSR1P13856 272 aa1.15□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C QRI5P32344 111 aa1.15□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YUH1P35127 236 aa1.15□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data1.15□□□□□ -2.23not detected
HDA3YPR179C PRS2P38620 318 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C DSN1P40568 576 aa1.15□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C AGX1P43567 385 aa1.15□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YJL028WP47062 111 aa1.15□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SSU72P53538 206 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C AAH1P53909 347 aa1.15□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C PLB3Q08108 686 aa1.15□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RRT8Q08219 342 aa1.15□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YPL247CQ12523 523 aa1.15□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C MSF1P08425 469 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C POX1P13711 748 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C VPS3P23643 1011 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C DPB2P24482 689 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RPT5P33297 434 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SFC1P33303 322 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C MED6P38782 295 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C BIG1P38813 335 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C TEM1P38987 245 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C BOP2Q06150 570 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SMT3Q12306 101 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C CWP1P28319 239 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C GDH2P33327 1092 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C MAL32P38158 584 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YHR045WP38775 560 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SPT8P38915 602 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C MDM34P53083 459 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C MAL12P53341 584 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YDR209CQ03480 137 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C EMI1Q04406 187 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SDO1Q07953 250 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YOR268CQ08734 132 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C PST1Q12355 444 aa1.14□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RAD3P06839 778 aa1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C DPM1P14020 267 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C PPH21P23594 369 aa1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RNP1P32385 249 aa1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C JEN1P36035 616 aa1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C PRS4P38063 326 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C MRX3P38172 270 aa1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SMB1P40018 196 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C GON7P46984 123 aa1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C GRH1Q04410 372 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C ATG17Q06410 417 aa1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C CDD1Q06549 142 aa1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SLD7Q08457 257 aa1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C GEP5Q12393 293 aa1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SNF8Q12483 233 aa1.13□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C EHD3P28817 500 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C ECM13P38195 257 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C GLG2P47011 380 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YNL134CP53912 376 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C ASI3P53983 676 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YOR029WQ12243 111 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YPR011CQ12251 326 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YBL008W-AQ3E821 79 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RNA15P25299 296 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C HOM6P31116 359 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C DRE2P36152 348 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SNZ3P43545 298 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C BNA6P43619 295 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C DSK2P48510 373 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YGL034CP53186 121 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RGM1Q00453 211 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C CTF19Q02732 369 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YLR173WQ06247 608 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C COQ10Q08058 207 aa1.12□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RPL26AP05743 127 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YKR104WP0CE69 306 aa1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YBR096WP38256 230 aa1.11□□□□□ -2.23
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