RNA–Protein interactions for RNA: YML071C

COG8, Transcript of Component of the conserved oligomeric Golgi complex, yeast

Gene COG8, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COG8	YML071C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	SPT8	P38915	602 aa		0.49	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	RPE1	P46969	238 aa		0.49	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	YJL016W	P47072	561 aa		0.49	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	YNL146W	P53906	100 aa		0.49	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	INM2	Q05533	292 aa		0.49	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	YPL247C	Q12523	523 aa		0.49	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	RAD10	P06838	210 aa		0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	TPO5	P36029	618 aa		0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	TPN1	P53099	579 aa		0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	BUR2	Q05949	395 aa		0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	YOR268C	Q08734	132 aa		0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	YCR025C	P25352	136 aa		0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	YCR102C	P25608	368 aa		0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	MCH2	P36032	473 aa		0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	YGL114W	P53134	725 aa		0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	COG7	P53195	279 aa		0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	MRS2	Q01926	470 aa		0.48	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	FKS3	Q04952	1785 aa		0.47	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	ZRT1	P32804	376 aa		0.47	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	VAB2	P40003	282 aa		0.47	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	YJL118W	P47022	219 aa		0.47	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	SPO24	Q3E752	67 aa		0.47	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		0.47	□□□□□ -2.33
COG8	YML071C	STE3	P06783	470 aa		0.46	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YOL162W	P0CF19	215 aa		0.46	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	DOA4	P32571	926 aa		0.46	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YBR062C	P38239	180 aa		0.46	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	PHO89	P38361	574 aa		0.46	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YNL143C	P53908	130 aa		0.46	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	EOS1	P53938	366 aa		0.46	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YDR262W	Q12331	272 aa		0.46	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	SGA1	P08019	549 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	PUT1	P09368	476 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	KRE6	P32486	720 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	PEP8	P40335	379 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	SWC4	P53201	476 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YGR168C	P53293	376 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	CAB5	Q03941	241 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	SKS1	Q12505	502 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	TY4B-J	P47024	1803 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	ERG2	P32352	222 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	SCM4	P32564	187 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	SFC1	P33303	322 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YHI9	P38765	294 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	CAB4	P53332	305 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	IZH4	Q99393	312 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		0.45	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	CDC7	P06243	507 aa		0.44	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	RAD7	P06779	565 aa		0.44	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	COT1	P32798	439 aa		0.44	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YDR089W	P38966	869 aa		0.44	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	MOB1	P40484	314 aa		0.44	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	GON7	P46984	123 aa		0.44	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YOL019W	Q08157	551 aa		0.44	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	KRE5	P22023	1365 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	AEP1	P32493	518 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YPC1	P38298	316 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	DSE2	P38844	325 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	SEN34	P39707	275 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YER135C	P40082	130 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	JEM1	P40358	645 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	AVT7	P40501	490 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	UBC13	P52490	153 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	RSC1	P53236	928 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	DAD3	P69850	94 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	ECM18	Q04623	453 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.43	□□□□□ -2.34	not detected
COG8	YML071C	POP8	P38208	133 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	INA22	P40576	216 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	OKP1	P53298	406 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	RSM10	Q03201	203 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	STE23	Q06010	1027 aa		0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YKR045C	P36138	183 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	TAD2	P47058	250 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	NUP57	P48837	541 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YPL039W	Q03080	316 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	PRM15	Q03262	622 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YPR1	Q12458	312 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YPR064W	Q12492	139 aa		0.42	□□□□□ -2.34
COG8	YML071C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		0.42	□□□□□ -2.34

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