RNA–Protein interactions for RNA: YER127W

LCP5, Essential protein involved in maturation of 18S rRNA, yeast

Gene LCP5, Length 1,074 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LCP5	YER127W	PMT4	P46971	762 aa		5.01	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	YGR266W	P53326	701 aa		5.01	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	CDC14	Q00684	551 aa		5.01	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	SNX41	Q04053	625 aa		5.01	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	ATG10	Q07879	167 aa		5.01	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	PHO13	P19881	312 aa		5	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	YMR262W	P38430	313 aa		5	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	EFM1	P38732	585 aa		5	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	YER184C	P39961	794 aa		5	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	SWC4	P53201	476 aa		5	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	YLR413W	Q06689	675 aa		5	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	BSC6	Q08280	497 aa		5	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	DAS2	Q12084	232 aa		5	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	DAL82	P21705	255 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	CWP1	P28319	239 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	HIS2	P38635	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	ECM11	Q04110	302 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	SIA1	Q12212	622 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	MDM35	O60200	86 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	INO2	P26798	304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	PET8	P38921	284 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	COX16	P47081	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	GPI8	P49018	411 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	NBP35	P52920	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	SED5	Q01590	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	SPO19	Q03029	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	INP1	Q03694	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	ECM18	Q04623	453 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	PLB3	Q08108	686 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	VPS68	Q12016	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	IRA1	P18963	3092 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	PPH21	P23594	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	RCK1	P38622	512 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	CIS3	P47001	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	RSM10	Q03201	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	APC4	Q04601	652 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCP5	YER127W	CSM1	P25651	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	AEP1	P32493	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	TIP20	P33891	701 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	FMP48	P53233	369 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	MIM1	Q08176	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	COX5A	P00424	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	GPI12	P23797	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	CYM1	P32898	989 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	KAP114	P53067	1004 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	BIO4	P53630	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	GTT2	Q12390	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	OCA6	Q12454	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	YLR462W	O13556	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	SRB4	P32569	687 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	TAF14	P35189	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	YHL049C	P38722	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	CYC2	P38909	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	YFL064C	P43540	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	YGL185C	P53100	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	SDS23	P53172	527 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	EMI1	Q04406	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	APC9	Q12107	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	QCR6	P00127	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	ZIP1	P31111	875 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	ZRG17	P53735	605 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	PIN3	Q06449	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	HFA1	P32874	2273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	YKL187C	P34231	750 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	MCH2	P36032	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	TIM13	P53299	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	YNR066C	P53752	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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