RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSA4	YER103W	CPR4	P25334	318 aa		11.56	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	YIL089W	P40500	205 aa		11.56	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	YGR012W	P53206	393 aa		11.56	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	HNM1	P19807	563 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	VMA16	P23968	213 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	RNQ1	P25367	405 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	ADH7	P25377	361 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	DMA1	P38823	416 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	SPC25	P40014	221 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	RSM10	Q03201	203 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	HDA2	Q06629	674 aa		11.55	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	FUN14	P18411	198 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	DCG1	P32460	244 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	FMT1	P32785	401 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	YER158C	P40095	573 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	AVT7	P40501	490 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	NPY1	P53164	384 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	SNO4	Q04902	237 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	RDR1	Q08904	546 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	HSP32	Q08992	237 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	PDE1	P22434	369 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	GIP2	P40036	548 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	VNX1	P42839	908 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	PET20	Q99373	253 aa		11.54	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	URA6	P15700	204 aa		11.53	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	POP8	P38208	133 aa		11.53	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	YGL235W	P53071	178 aa		11.53	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	CYT2	Q00873	224 aa		11.53	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	YPL014W	Q02606	381 aa		11.53	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	TMA23	Q03525	211 aa		11.53	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	ORT1	Q12375	292 aa		11.53	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	SET6	Q12529	373 aa		11.53	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	LAC1	P28496	418 aa		11.52	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	DLS1	P40366	167 aa		11.52	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	PRY3	P47033	881 aa		11.52	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	ADD37	Q03233	198 aa		11.52	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	SYM1	Q06563	197 aa		11.52	□□□□□ -0.56
SSA4	YER103W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	YCR101C	P25607	182 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	POP5	P28005	173 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	EHT1	P38295	451 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	RPB5	P20434	215 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	PTP1	P25044	335 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	MGA1	P53050	456 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	SKO1	Q02100	647 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	TMN2	Q04562	672 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	SUT2	Q12286	268 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	TMA17	Q12513	150 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	COA6	Q3E846	104 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	SEC62	P21825	274 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	MDL1	P33310	695 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	OMA1	P36163	345 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	MRPL15	P36523	253 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	CHK1	P38147	527 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	ROT1	Q03691	256 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	ROY1	Q04847	553 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	BNA5	Q05979	453 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	FDH1	Q08911	376 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	SUL2	Q12325	893 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	YLR118C	Q12354	227 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	BXI1	P48558	297 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	UFD1	P53044	361 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	AVO2	Q04749	426 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	SNF5	P18480	905 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	CCC1	P47818	322 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	BNS1	P50084	137 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	CTR3	Q06686	241 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	HEM25	Q07534	307 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	MSB2	P32334	1306 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	CCH1	P50077	2039 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	MGE1	P38523	228 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	CHS7	P38843	316 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	YIP4	P53093	235 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	YGR035C	P53222	116 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	VPS62	P53285	467 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	YAP1802	P53309	568 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	MTM1	P53320	366 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSA4	YER103W	GMC1	Q04399	608 aa		11.48	□□□□□ -0.57

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 61.4 ms