RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273411.2

RPL39P5-201, Transcript of ribosomal protein L39 pseudogene 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPL39P5, Length 449 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5-201ENST00000273411 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 OPA1O60313 960 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 EFCAB14O75071 495 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 KATNA1O75449 491 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 CTDNEP1O95476 244 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 NEK4P51957 841 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 PPIL2Q13356 520 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 ACAP1Q15027 740 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 NTRK3Q16288 839 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 AAK1Q2M2I8 961 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 CHST3Q7LGC8 479 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 CDH24Q86UP0 819 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 ERO1BQ86YB8 467 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 PTPRN2Q92932 1015 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 SNX21Q969T3 373 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 TRIM11Q96F44 468 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 SCLYQ96I15 445 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 NEK1Q96PY6 1258 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 GJD2Q9UKL4 321 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 NID2Q14112 1375 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 BPTFQ12830 3046 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 FRYQ5TBA9 3013 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 LOC285556D6RIA3 1793 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 RFXAPO00287 272 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 KPNA6O60684 536 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 DTNBO60941 627 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 SLITRK5O94991 958 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 NPTXRO95502 500 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 ASLP04424 464 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 APPP05067 770 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 SNHG28P0DPA3 235 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 DDIT3P35638 169 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 TDO2P48775 406 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 AK2P54819 239 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 GFRA1P56159 465 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 TFAP4Q01664 338 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 TROAPQ12815 778 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 MAP4K2Q12851 820 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 CUL4AQ13619 759 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 PPP2R5DQ14738 602 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 ACER1Q8TDN7 264 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 MTA3Q9BTC8 594 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 ASPNQ9BXN1 380 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 PRC1O43663 620 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 RAB6AP20340 208 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 HOXC12P31275 282 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 IGFALSP35858 605 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 ETV3P41162 512 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 LIFRP42702 1097 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 KCNJ6P48051 423 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 EPHB1P54762 984 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 SEPT2Q15019 361 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 DHCR24Q15392 516 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 ME3Q16798 604 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 TRIM60Q495X7 471 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 CASC1Q6TDU7 716 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 Q6ZUG5 572 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 FIBCD1Q8N539 461 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL39P5-201ENST00000273411 RNF141Q8WVD5 230 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms