RNA–Protein interactions for RNA: YKR082W

NUP133, Transcript of Subunit of Nup84p subcomplex of nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP133, Length 3,474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP133	YKR082W	CYC3	P06182	269 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	COR1	P07256	457 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	NUP1	P20676	1076 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	ELO2	P25358	347 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	OCH1	P31755	480 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	MSK1	P32048	576 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YKL075C	P36083	450 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	QDR3	P38227	689 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	SET4	P42948	560 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	PRY3	P47033	881 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	POP6	P53218	158 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	MKC7	P53379	596 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	ATG39	Q06159	398 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	SAL1	D6W196	494 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	DDI2	P0CH63	225 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	DDI3	P0CH64	225 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YCR023C	P25351	611 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	PRY2	P36110	329 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	CEM1	P39525	442 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YAL037W	P39728	267 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	FAR3	P46671	204 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	OST3	P48439	350 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	MMS2	P53152	137 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	SEI1	Q06058	285 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	CYK3	Q07533	885 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	ENB1	Q08299	606 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	MDM32	Q12171	622 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	SEC59	P20048	519 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	PHO80	P20052	293 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	JEN1	P36035	616 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YHR033W	P38690	423 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	ARP1	P38696	384 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	SSN3	P39073	555 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	COX18	P53239	316 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	GTR2	P53290	341 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YDR124W	Q04608	324 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	PEX27	Q08580	376 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YLL056C	Q12177	298 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	HTA2	P04912	132 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	CHL4	P38907	458 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YER076C	P40049	302 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	COS12	P53053	380 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YNR062C	P53748	327 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	ODC1	Q03028	310 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YMR166C	Q03829	368 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	GPI17	Q04080	534 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YMR087W	Q04299	284 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	VBA1	Q04301	562 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	RRG9	P40156	214 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	GTS1	P40956	396 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	AZF1	P41696	914 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	XPT1	P47165	209 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	AIF1	P52923	378 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	FLC3	P53121	802 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	TMA23	Q03525	211 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YML096W	Q04489	525 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	ECI1	Q05871	280 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	STP3	Q05937	343 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	RNH203	Q12338	110 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	AAC1	P04710	309 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	CCA1	P21269	546 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	SDH2	P21801	266 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	SEC22	P22214	214 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	KIN82	P25341	720 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	MRPL6	P32904	214 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	SHP1	P34223	423 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	DSE1	P40077	573 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	ARG2	P40360	574 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NUP133	YKR082W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50.7 ms