RNA–Protein interactions for RNA: YJL054W

TIM54, Transcript of Component of the mitochondrial TIM22 complex, yeast

Gene TIM54, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIM54	YJL054W	CRZ1	P53968	678 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TIM54	YJL054W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
TIM54	YJL054W	TIM44	Q01852	431 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TIM54	YJL054W	SKO1	Q02100	647 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TIM54	YJL054W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TIM54	YJL054W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TIM54	YJL054W	BNA7	Q04066	261 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TIM54	YJL054W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TIM54	YJL054W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
TIM54	YJL054W	IZH2	Q12442	317 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TIM54	YJL054W	BPH1	P25356	2167 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TIM54	YJL054W	PMR1	P13586	950 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	DAL80	P26343	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	MRPL6	P32904	214 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YBR096W	P38256	230 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	GET2	P40056	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	HMS2	P47175	358 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	SBH2	P52871	88 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RMR1	P53060	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	IPK1	Q06667	281 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	UIP4	Q08926	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	SRL2	Q12020	392 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	VIK1	Q12045	647 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	MSW1	P04803	379 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	PTP2	P29461	750 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	VPH2	P32341	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	CLB6	P32943	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	ECM14	P38836	430 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	SLZ1	P40167	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	IRC5	P43610	853 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YIP5	P53108	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RRN9	P53437	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	MNT4	P53745	580 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	MCH4	Q08268	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RNH203	Q12338	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RIB3	Q99258	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	OPI3	P05375	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YME2	P32843	850 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RTC2	P38279	296 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	SBE22	P38814	852 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	CHL4	P38907	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	BUR6	P40096	142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YIL029C	P40538	142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YIR020C	P40575	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	EGT2	P42835	1041 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	UBC13	P52490	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	SED1	Q01589	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	SPC19	Q03954	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	MCT1	Q12283	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RTN2	Q12443	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	STE50	P25344	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	UBC8	P28263	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	MNS1	P32906	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	CLG1	P35190	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YBR063C	P38083	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	NNT1	Q05874	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	MLC2	Q06580	163 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	GAT3	Q07928	141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RRI1	Q12468	440 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	FSH3	Q99369	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	REP1	P03871	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	SCEI	P03882	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	SNF4	P12904	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	CPR2	P23285	205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	SPT10	P35208	640 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	APL3	P38065	1025 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	HIS6	P40545	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	NCA3	P46955	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YJL055W	P47044	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	ABM1	P47146	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YGR016W	P53209	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	OST6	Q03723	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RNH1	Q04740	348 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	ELP6	Q04868	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	RTR2	Q12378	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	PHO80	P20052	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	DAL3	P32459	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIM54	YJL054W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.3 ms