RNA–Protein interactions for RNA: YAL038W

CDC19, Transcript of Pyruvate kinase, yeast

Gene CDC19, Length 1,503 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CDC19	YAL038W	SPO77	Q06134	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	RNH203	Q12338	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	YLR358C	O13565	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	FAR1	P21268	830 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	YCR061W	P25639	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	UBC8	P28263	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	NTG1	P31378	399 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	PUP2	P32379	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	MDL1	P33310	695 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	ELF1	P36053	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	SPC34	P36131	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	YER121W	P40076	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	YIR020C	P40575	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	POP1	P41812	875 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	NCA3	P46955	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	NUP57	P48837	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	MTM1	P53320	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	NDL1	Q06568	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	MFG1	Q07684	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	COQ10	Q08058	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	RRT8	Q08219	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	USV1	Q12132	391 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	SFM1	Q12314	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	VCX1	Q99385	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	RAD7	P06779	565 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	YPK2	P18961	677 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	RPB8	P20436	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	TIM12	P32830	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	TRS65	P32893	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	GPX1	P36014	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	JEN1	P36035	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	AVT6	P40074	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	IDS2	P46958	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	YAP1802	P53309	568 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	IGO1	P53897	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
CDC19	YAL038W	ARO10	Q06408	635 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	SYO1	Q07395	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	MSA1	Q08471	629 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	VIK1	Q12045	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	RTR2	Q12378	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC19	YAL038W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	TIM9	O74700	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	SPO7	P18410	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	GIT1	P25346	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	SNC1	P31109	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	MNS1	P32906	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	GOS1	P38736	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	PSD1	P39006	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	SNM1	P40993	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	SRB7	P47822	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	UBC13	P52490	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	HMS1	Q12398	434 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	RTN2	Q12443	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	DBF2	P22204	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	MRP20	P32387	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	SEC66	P33754	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	NUF2	P33895	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	YIL166C	P40445	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	MSS2	P40990	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	ABM1	P47146	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	BRR6	P53062	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	CIK1	Q01649	594 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	FIT3	Q08907	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	MSH5	Q12175	901 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	TPK3	P05986	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	CLB6	P32943	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	HCS1	P34243	683 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	SPT10	P35208	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	RIB1	P38066	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	ECM8	P38246	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	YGR151C	P53287	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	FMP42	Q04991	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC19	YAL038W	RKI1	Q12189	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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