RNA–Protein interactions for RNA: YPR175W

DPB2, Transcript of Second largest subunit of DNA polymerase II (DNA polymerase epsilon), yeast

Gene DPB2, Length 2,070 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DPB2	YPR175W	FSH2	Q05015	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	RKR1	Q04781	1562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	SSN2	P38931	1420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	REV1	P12689	985 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	APA2	P22108	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	GIT1	P25346	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YCR025C	P25352	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	RAD51	P25454	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	QRI5	P32344	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	BOR1	P53838	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	SLT2	Q00772	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	GMC1	Q04399	608 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YOS9	Q99220	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	BNI1	P41832	1953 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	SHE1	P38200	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TDA11	P38854	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YGR015C	P53208	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YNR066C	P53752	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	DPP1	Q05521	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	PLP2	Q12017	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	JID1	Q12350	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	ZRC1	P20107	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	VEL1	P53058	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	KRE28	Q04431	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	CSM4	Q08955	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TIP41	Q12199	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	ATG15	P25641	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	MBA1	P38300	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YFR057W	P43625	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YPS5	P53057	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	PPA2	P28239	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YBL059W	P34224	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	MIC12	P38341	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	ASG7	P46993	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	PGU1	P47180	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	ADD37	Q03233	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	MHP1	P43638	1398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YPK9	Q12697	1472 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	MER1	P16523	270 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	LDS1	P31379	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YIA6	P40556	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	DSN1	P40568	576 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	STE7	P06784	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	AEP1	P32493	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	OXA1	P39952	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	MRPL50	P53724	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YNL095C	P53932	642 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YET2	Q04210	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	CTR3	Q06686	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	LAG2	Q92325	660 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	COQ1	P18900	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	URA10	P30402	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	TIM17	P39515	158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YJR079W	P47126	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	SDS23	P53172	527 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	RMI1	Q02685	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	RPO31	P04051	1460 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YCR102C	P25608	368 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DPB2	YPR175W	BMT2	P38278	337 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DPB2	YPR175W	MIG3	P39943	394 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DPB2	YPR175W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
DPB2	YPR175W	ERG28	P40030	148 aa		4.84	□□□□□ -1.64

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