RNA–Protein interactions for RNA: YML031W

NDC1, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NDC1, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NDC1	YML031W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	MRPL19	P53875	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	HXT11	P54862	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	RRT8	Q08219	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	ERD2	P18414	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	ITR1	P30605	584 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	DBF20	P32328	564 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	NDC1	P32500	655 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	JEN1	P36035	616 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	NAT2	P37293	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YIL165C	P40446	119 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	ARO10	Q06408	635 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	IRC19	Q07843	230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	GEP5	Q12393	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	RTN2	Q12443	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	FPS1	P23900	669 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YBR220C	P38318	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	MET28	P40573	187 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	HMS2	P47175	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	SPO77	Q06134	477 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
NDC1	YML031W	OAC1	P32332	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YBR137W	P38276	179 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	MDM31	P38880	579 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	NVJ1	P38881	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YIL012W	P40551	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	AAD14	P42884	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YGR201C	P42936	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	IRC7	P43623	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	VPS36	Q06696	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	SET6	Q12529	373 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	HYM1	P32464	399 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	SLC1	P33333	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	COS9	P36034	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	SBE22	P38814	852 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	FET3	P38993	636 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	MSS4	P38994	779 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	BUR6	P40096	142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YNL195C	P40168	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	MOB2	P43563	287 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	ATG18	P43601	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	BUD9	P53226	547 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	ATP16	Q12165	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	RLM1	Q12224	676 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	SFM1	Q12314	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	SNC1	P31109	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	SNM1	P40993	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	SCS7	Q03529	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	BTS1	Q12051	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	MRX4	Q12467	430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	DFG16	Q99234	619 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	PET54	P10834	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	MRPL3	P36516	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	RRN9	P53437	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	MNT4	P53745	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	AIM36	Q03798	255 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	FRE5	Q08908	694 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	ATP14	Q12349	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	PPG1	P32838	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	SPC29	P33419	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YHR035W	P38769	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	CTF8	P38877	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	HPA3	P39979	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	TIR3	P40552	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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