RNA–Protein interactions for RNA: YML015C

TAF11, Transcript of TFIID subunit (40 kDa), yeast

Gene TAF11, Length 1,041 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TAF11	YML015C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	YBR241C	P38142	488 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	SHE1	P38200	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	BMT2	P38278	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	SLM1	P40485	686 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	IGD1	P43598	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	KEL2	P50090	882 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	SDT1	P53078	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	SPR1	P32603	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	SNX41	Q04053	625 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	YDR115W	Q04598	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	FAR10	Q06001	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	IES6	P32617	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	YKL071W	P36086	256 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	HIS2	P38635	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	FMP33	P46998	180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	TPC1	P53257	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	RNH201	P53942	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	SED5	Q01590	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	MHR1	Q06630	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	PRM4	Q12498	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	IZH4	Q99393	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	ERD1	P16151	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	STB1	P42845	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	AGP3	P43548	558 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	VHT1	P53241	593 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	RRT8	Q08219	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	NCB2	Q92317	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	ATP6	P00854	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	YUH1	P35127	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	RCY1	P39531	840 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	SCC4	P40090	624 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	NRM1	P53718	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	SPP2	Q02521	185 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TAF11	YML015C	COX4	P04037	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	COQ1	P18900	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
TAF11	YML015C	TPO5	P36029	618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	MCH2	P36032	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	YPC1	P38298	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	RCK1	P38622	512 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	GDS1	P41913	522 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	PGU1	P47180	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	SWC4	P53201	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	RMI1	Q02685	241 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	SUE1	Q06524	206 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	MMT2	Q08970	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	GPI18	P38211	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	PET8	P38921	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	YLR152C	P54072	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	MRX11	Q03079	207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	ASR1	Q06834	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	RIF1	P29539	1916 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	REV1	P12689	985 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	YSR3	P23501	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	INO2	P26798	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	RPC37	P36121	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	TIS11	P47977	285 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	UBC13	P52490	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	LIF1	P53150	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	IRA1	P18963	3092 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	CCH1	P50077	2039 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	PDR18	P53756	1333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	PCL1	P24867	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	YOX1	P34161	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	YKL063C	P35725	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	SLX1	P38324	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	PET100	P38958	111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	RRN5	Q02983	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	GPN3	Q06543	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	MIM1	Q08176	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TAF11	YML015C	POM33	Q12164	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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