RNA–Protein interactions for RNA: YLR234W

TOP3, Transcript of DNA Topoisomerase III, yeastyeast

Gene TOP3, Length 1,971 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOP3YLR234W MSK1P32048 576 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W MGE1P38523 228 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SNM1P40993 198 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SSU1P41930 458 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YDR344CQ05510 147 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W GRC3Q07845 632 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W RFU1Q08003 200 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W IRC10Q08118 586 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W TMS1Q12116 473 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YJR112W-AQ3E743 109 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W COA6Q3E846 104 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W DST1P07273 309 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W TFS1P14306 219 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W PRE1P22141 198 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W RPD3P32561 433 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SPS19P32573 292 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W THI80P35202 319 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data7□□□□□ -1.29not detected
TOP3YLR234W DHH1P39517 506 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W NUP57P48837 541 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W TIM21P53220 239 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SAE3P89114 91 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YKR011CQ02209 353 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W STD1Q02794 444 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W ARG7Q04728 441 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SKS1Q12505 502 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W ATP5P09457 212 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SEC22P22214 214 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SFK1P35735 353 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W DOA1P36037 715 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W TIM17P39515 158 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SLZ1P40167 298 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W MEP2P41948 499 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W PFS2P42841 465 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W FLC3P53121 802 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W ALG12P53730 551 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W NRK1P53915 240 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YSA1Q01976 231 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YPL272CQ08984 517 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W TMA17Q12513 150 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YLR099W-AQ3E798 87 aa7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W ADH2P00331 348 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SNF5P18480 905 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W CPR4P25334 318 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W ATG15P25641 520 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W EHD3P28817 500 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SOF1P33750 489 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W MRPL4P36517 319 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W MED6P38782 295 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W FLX1P40464 311 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W PAM16P42949 149 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W TIS11P47977 285 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W CYT2Q00873 224 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W TGL5Q12043 749 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W HTA1P04911 132 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W STE4P18851 423 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W EPT1P22140 391 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YJU3P28321 313 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W GSP1P32835 219 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W GSP2P32836 220 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W TIP20P33891 701 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SRO77P38163 1010 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W HSE1P38753 452 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W AXL2P38928 823 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W GIM4P40005 111 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W CAT5P41735 233 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W HXT14P42833 540 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YJR056CP47115 236 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W BUL1P48524 976 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SOL1P50278 321 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W AVT4P50944 713 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YGR012WP53206 393 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W SHY1P53266 389 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YPL067CQ02754 198 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YHM2Q04013 314 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W AIM6Q07716 390 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W HOP1P20050 605 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W PET18P25362 215 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W CLB6P32943 380 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W CHS7P38843 316 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W EMC5P40540 141 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W GAT1P43574 510 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YJR012CP47087 207 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3YLR234W YJR149WP47177 404 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.2 ms