RNA–Protein interactions for RNA: YHL038C

CBP2, Required for splicing of the group I intron bI5 of the COB pre-mRNA, yeast

Gene CBP2, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBP2	YHL038C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	NTG1	P31378	399 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	LDS1	P31379	325 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	HYM1	P32464	399 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	SPR1	P32603	445 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	CAF4	P36130	643 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	YHR131C	P38835	850 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	SPL2	P38839	148 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	HAT2	P39984	401 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	AGP3	P43548	558 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	PMT5	P52867	743 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	DOC1	P53068	250 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
CBP2	YHL038C	PIR3	Q03180	325 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	TRM82	Q03774	444 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	NUP53	Q03790	475 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	YPR091C	Q06833	770 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	MDM32	Q12171	622 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	MAS1	P10507	462 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	MAS2	P11914	482 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	COQ1	P18900	473 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	GIT1	P25346	518 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	YCR043C	P25361	127 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RNP1	P32385	249 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	GPX2	P38143	162 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	HIS2	P38635	335 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	ATM1	P40416	690 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	YIL054W	P40524	105 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	AGX1	P43567	385 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	TOS3	P43637	560 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	UBC12	P52491	188 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	MRH4	P53166	561 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	GET1	P53192	235 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RUB1	Q03919	77 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	YPR063C	Q12160	140 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RNH203	Q12338	110 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	HRT3	Q12347	344 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RMD5	Q12508	421 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	MED11	Q99278	115 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	TY4B-J	P47024	1803 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	CAP2	P13517	287 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	UGA1	P17649	471 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	SAG1	P20840	650 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	YCR022C	P25620	114 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	MGT1	P26188	188 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	UBC8	P28263	218 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	ARO7	P32178	256 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	KKQ8	P36004	724 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	MRPL3	P36516	390 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	NVJ1	P38881	321 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	SER2	P42941	309 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	YFL040W	P43562	540 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	GRX5	Q02784	150 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RRN5	Q02983	363 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	YET3	Q07451	203 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	ESA1	Q08649	445 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	SCP1	Q08873	200 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	SRL2	Q12020	392 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RPN6	Q12377	434 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RPL12B	P0CX54	165 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	PET54	P10834	293 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	GRR1	P24814	1151 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	PTM1	P32857	523 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	SPO23	P33757	523 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	ZRT3	P34240	503 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	PMU1	P36069	295 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	YHR177W	P38867	453 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	FHL1	P39521	936 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	MST28	P39552	234 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	ERV14	P53173	138 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	HHO1	P53551	258 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	RCF2	P53721	224 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CBP2	YHL038C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected

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