RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C IRC7P43623 340 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C AIM22P47051 409 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C GPI14P47088 403 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C DAN1P47178 298 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C GPI1P53306 609 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MKC7P53379 596 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C HSP31Q04432 237 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C AAD4Q07747 329 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ATG10Q07879 167 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YOR365CQ08844 703 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RGT2Q12300 763 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PDH1Q12428 516 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C SFG1Q12507 346 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C NBL1Q3E7Y6 73 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MHF1Q3E835 90 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PHO2P07269 559 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C NHP6BP11633 99 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C CBS1P14066 229 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C URK1P27515 501 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data2.92□□□□□ -1.94not detected
DOA4YDR069C WBP1P33767 430 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C BNA4P38169 460 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ZTA1P38230 334 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ERG7P38604 731 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C SRP14P38985 146 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YJL068CP40363 299 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PMT6P42934 759 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C GWT1P47026 490 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YJR096WP47137 282 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PHO23P50947 330 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MDM34P53083 459 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C DUO1P53168 247 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C JAC1P53193 184 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ERV29P53337 310 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YDR366CP87287 132 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RSM10Q03201 203 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C CGI121Q03705 181 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C CTK1Q03957 528 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MRPL1Q04599 285 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ASM4Q05166 528 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YLR456WQ06199 204 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RIF2Q06208 395 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C TGS1Q12052 315 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YDR262WQ12331 272 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C TRM13Q12383 476 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RIM15P43565 1770 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data2.92□□□□□ -1.94not detected
DOA4YDR069C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ZRC1P20107 442 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C LSB5P25369 354 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ACB1P31787 87 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MSK1P32048 576 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C DCG1P32460 244 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C UPS2P35200 230 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PTK1P36002 662 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C SDH4P37298 181 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data2.92□□□□□ -1.94not detected
DOA4YDR069C NTC20P38302 140 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C WSC4P38739 605 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C SFB3P38810 929 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PHO90P39535 881 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MIT1P40002 666 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YER085CP40058 173 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C GPP1P41277 250 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RPS12P48589 143 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ASN1P49089 572 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MPC1P53157 130 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ELC1Q03071 99 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MMT2Q08970 484 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C DAP1Q12091 152 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PST2Q12335 198 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ATG5Q12380 294 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C AHA1Q12449 350 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YLR361C-AQ3E795 98 aa2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C QCR7P00128 127 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ALG7P07286 448 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C EMP24P32803 203 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MTH1P35198 433 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YBR053CP38235 358 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YHL044WP38727 235 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C FMP52P40008 231 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PRE6P40303 254 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C FAR3P46671 204 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C FLC3P53121 802 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C TIM21P53220 239 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YDR391CQ04170 232 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ERP1Q05359 219 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C IZH3Q07959 543 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C BSC6Q08280 497 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C SLF1Q12034 447 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C CAR1P00812 333 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C TIR1P10863 254 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data2.91□□□□□ -1.94not detected
DOA4YDR069C ATP10P18496 279 aa2.91□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MIH1P23748 554 aa2.91□□□□□ -1.94
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