RNA–Protein interactions for RNA: Q0142

Q0142, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0142, Length 177 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0142Q0142 AAH1P53909 347 aa-0.35□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 THR4P16120 514 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 YBR219CP38317 127 aa-0.36□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 SNX4P47057 423 aa-0.36□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 SRB7P47822 140 aa-0.36□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 AIM36Q03798 255 aa-0.36□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 PXR1P53335 271 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 YNL143CP53908 130 aa-0.37□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 CSI2Q08054 341 aa-0.37□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 VAR1P02381 398 aa-0.38□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 SPT8P38915 602 aa-0.38□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 YHB1P39676 399 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 EFM4P40516 257 aa-0.38□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 ECM18Q04623 453 aa-0.38□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 IFM1P25038 676 aa-0.39□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 YBL112CQ3E7Y4 105 aa-0.39□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 HSP82P02829 709 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 YHR122WP38829 231 aa-0.4□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 YIL089WP40500 205 aa-0.4□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 YLR446WQ06204 433 aa-0.4□□□□□ -2.47
Q0142Q0142 FBA1P14540 359 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 MDH2P22133 377 aa-0.41□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data-0.41□□□□□ -2.48not detected
Q0142Q0142 YPL039WQ03080 316 aa-0.41□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 PEX12Q04370 399 aa-0.41□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 TOR2P32600 2474 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 TOR1P35169 2470 aa-0.41□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 BMH1P29311 267 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 BMT5P40493 336 aa-0.42□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 MLC1P53141 149 aa-0.42□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 MHT1Q12525 324 aa-0.42□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 TAF6P53040 516 aa-0.43□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 PRM15Q03262 622 aa-0.43□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 RGS2Q99188 309 aa-0.43□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 RPN12P32496 274 aa-0.44□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 RIO1Q12196 484 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 CSF1Q12150 2958 aa-0.44□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 SCL1P21243 252 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 PHO89P38361 574 aa-0.45□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 TCD1P38756 429 aa-0.45□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 VAB2P40003 282 aa-0.45□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 BTT1P40314 149 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 YNR068CP53754 272 aa-0.45□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 UTP20P35194 2493 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 YLL053CP0CD98 152 aa-0.46□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 SNX41Q04053 625 aa-0.46□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 CPA1P07258 411 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 PRM10P42946 383 aa-0.47□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 UTP23Q12339 254 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
Q0142Q0142 DSF1P0CX08 502 aa-0.48□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 YNR073CP0CX09 502 aa-0.48□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 POX1P13711 748 aa-0.48□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 ACB1P31787 87 aa-0.48□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 CAJ1P39101 391 aa-0.48□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 AVT7P40501 490 aa-0.48□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 TAD2P47058 250 aa-0.48□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 YGR016WP53209 190 aa-0.48□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 ERG2P32352 222 aa-0.49□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 JNM1P36224 373 aa-0.49□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 PEX4P29340 183 aa-0.5□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 COT1P32798 439 aa-0.5□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 RPL13BP40212 199 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 VMA2P16140 517 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 FAA1P30624 700 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 MCH2P36032 473 aa-0.51□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 YFL040WP43562 540 aa-0.51□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 IRC4Q03036 179 aa-0.51□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 SAS5Q99314 248 aa-0.51□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 TEL1P38110 2787 aa-0.52□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 CCA1P21269 546 aa-0.52□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 DPB2P24482 689 aaPredicted RBP-0.52□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 VMA5P31412 392 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 POP8P38208 133 aa-0.52□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 YLR162WQ06235 118 aa-0.52□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 IMP3P32899 183 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 GDH2P33327 1092 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 UPS2P35200 230 aa-0.53□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 SEN34P39707 275 aa-0.53□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 AVT2P39981 480 aa-0.53□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 UTP6Q02354 440 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
Q0142Q0142 CYR1P08678 2026 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 CUP1-1P0CX80 61 aa-0.54□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 CUP1-2P0CX81 61 aa-0.54□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 UBA1P22515 1024 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 DRE2P36152 348 aa-0.54□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 YPT32P51996 222 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 CYT2Q00873 224 aa-0.54□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 SPC19Q03954 165 aa-0.54□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 RPL6BP05739 176 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 VPH1P32563 840 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 MDL1P33310 695 aa-0.55□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 RVB1Q03940 463 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 IRA2P19158 3079 aa-0.56□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 YHR035WP38769 630 aa-0.56□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 YJL055WP47044 245 aa-0.56□□□□□ -2.5
Q0142Q0142 ERG25P53045 309 aa-0.56□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.7 ms