RNA–Protein interactions for RNA: YMR228W

MTF1, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase specificity factor, yeast

Gene MTF1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTF1	YMR228W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	CCH1	P50077	2039 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	DAL82	P21705	255 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	MAK31	P23059	88 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	RRT12	P25381	491 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	ZIP1	P31111	875 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	KRE6	P32486	720 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	ECM8	P38246	354 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	MET30	P39014	640 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	RPH1	P39956	796 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YFL067W	P43537	175 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	LCB3	P47013	409 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	MRPL50	P53724	139 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	ATG31	Q12421	196 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	AGA1	P32323	725 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	OTU1	P43558	301 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	NCA3	P46955	337 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	ASR1	Q06834	288 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	SNA4	Q07549	140 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	DDC1	Q08949	612 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	RIF1	P29539	1916 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	PRB1	P09232	635 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	HEM15	P16622	393 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YCR043C	P25361	127 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	SPO23	P33757	523 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	AVT5	P38176	459 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	SMF2	P38778	549 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YND1	P40009	630 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	COA1	P40452	197 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	SLM1	P40485	686 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YIA6	P40556	373 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YGR210C	P42942	411 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	GIM3	P53900	129 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	GTO3	Q04806	366 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	PAM18	Q07914	168 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YKL063C	P35725	167 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	CAB3	P36076	571 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	DRE2	P36152	348 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	SLX1	P38324	304 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	SWC4	P53201	476 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	MTQ1	P53944	314 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	POM33	Q12164	279 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MTF1	YMR228W	TRP1	P00912	224 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	HEM4	P06174	275 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	CTA1	P15202	515 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	ATS1	P31386	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	NUP2	P32499	720 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RPC37	P36121	282 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	TVP38	P36164	337 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	SIP3	P38717	1229 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	BIG1	P38813	335 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MDM31	P38880	579 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	HAC1	P41546	238 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	PMT4	P46971	762 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	TDA1	Q03533	586 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	FCY22	Q12119	530 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	HMS1	Q12398	434 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	YOS9	Q99220	542 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	ARG80	P07249	177 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MER1	P16523	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	FUN26	P31381	517 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	PRM5	P40476	318 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	YJL213W	P40896	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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