RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	MNT4	P53745	580 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	PET117	Q02771	107 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	MMT2	Q08970	484 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	MSF1	P08425	469 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	UTR1	P21373	530 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	GPI12	P23797	304 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	ERG9	P29704	444 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	MEI5	P32489	222 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	SRB4	P32569	687 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	CYM1	P32898	989 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.27	□□□□□ -2.05	not detected
YCT1	YLL055W	TIP20	P33891	701 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YKL071W	P36086	256 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	MMS21	P38632	267 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YHR045W	P38775	560 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YER085C	P40058	173 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YCH1	P42937	148 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	HST4	P53688	370 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	MRPL50	P53724	139 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	PGA2	P53903	129 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	SPP2	Q02521	185 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	MRX8	Q05473	314 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YOL029C	Q08187	201 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	MER1	P16523	270 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	DAL82	P21705	255 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YSR3	P23501	404 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	MSN4	P33749	630 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	EFM1	P38732	585 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	BNA6	P43619	295 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YAR1	P46683	200 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	NAS6	P50086	228 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	INP2	Q03824	705 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	GTO3	Q04806	366 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YLR283W	Q05867	314 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	TAF10	Q12030	206 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	CHD1	P32657	1468 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	RAD1	P06777	1100 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	CDC42	P19073	191 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	FRM2	P37261	193 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	IML3	P38265	245 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	TRR2	P38816	342 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	PRM9	P39551	298 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YIR035C	P40579	254 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	MSS2	P40990	351 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	FMP33	P46998	180 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	OKP1	P53298	406 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	NRM1	P53718	249 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YPR172W	Q06608	200 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YPS3	Q12303	508 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	RPN6	Q12377	434 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	ERP3	Q12403	225 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YOS9	Q99220	542 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	FLO11	P08640	1367 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	RAD3	P06839	778 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	CKA2	P19454	339 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YKL162C	P36052	402 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	PRY2	P36110	329 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	SLX1	P38324	304 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YHR035W	P38769	630 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	DSE1	P40077	573 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	UFE1	P41834	346 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	AGP3	P43548	558 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	OTU1	P43558	301 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	BIO4	P53630	237 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YPL077C	Q02831	240 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	CTS2	Q06350	511 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	YPR195C	Q06594	109 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	IZH4	Q99393	312 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	JIP3	O13555	125 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	COX2	P00410	251 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	MRPL25	P23369	157 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	CWP1	P28319	239 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	KRE6	P32486	720 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	ZRT1	P32804	376 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	AIM29	P36154	155 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	TIM21	P53220	239 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	HCH1	P53834	153 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	IRC4	Q03036	179 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	KRE28	Q04431	385 aa		2.23	□□□□□ -2.05

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