RNA–Protein interactions for RNA: YHR085W

IPI1, Transcript of Component of the Rix1 complex and possibly pre-replicative complexes, yeast

Gene IPI1, Length 1,005 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IPI1	YHR085W	MKK1	P32490	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	SSO1	P32867	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	SUR1	P33300	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	SKG1	P36169	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	YIL001W	P40560	513 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	TPC1	P53257	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	SPR6	Q01684	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	MCH4	Q08268	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	GET4	Q12125	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
IPI1	YHR085W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	DEP1	P31385	405 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	APD1	P38281	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RCK1	P38622	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	YHR218W	P38899	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	MLH1	P38920	769 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RTT105	P40063	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	MPM1	P40364	252 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	ICE2	P40499	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	HOC1	P47124	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	DUG3	P53871	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	MFG1	Q07684	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	BAR1	P12630	587 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	FZO1	P38297	855 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	CIN1	P40987	1014 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	SNM1	P40993	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	GET1	P53192	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	MMT1	Q03218	510 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	MUM3	Q08750	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
IPI1	YHR085W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	GAL3	P13045	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	ATP10	P18496	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	NUP1	P20676	1076 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	TFC1	P32367	649 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	NUP2	P32499	720 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	REC114	P32841	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RIB1	P38066	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	SNO3	P43544	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	KEL2	P50090	882 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	UBP8	P50102	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	MRK1	P50873	501 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	GOR1	P53839	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	ASI1	P54074	624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	BCP1	Q06338	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	NDL1	Q06568	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	GPI11	Q06636	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	MER1	P16523	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RPB5	P20434	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	GPI12	P23797	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	YBR139W	P38109	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	IKS1	P47042	667 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	EFM3	P47163	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	PAC10	P48363	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	TOS2	P50078	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
IPI1	YHR085W	INP1	Q03694	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	SMA2	Q04658	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	POS5	Q06892	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RAD7	P06779	565 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	CBS2	P14905	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RPB8	P20436	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	CNA1	P23287	553 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	RHB1	P25378	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	PMT2	P31382	759 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	MSN2	P33748	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	FES1	P38260	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPI1	YHR085W	POP1	P41812	875 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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