RNA–Protein interactions for RNA: YHR036W

BRL1, Transcript of Essential nuclear envelope integral membrane protein, yeast

Gene BRL1, Length 1,416 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRL1	YHR036W	GPI8	P49018	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SBH2	P52871	88 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SNF12	P53628	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	ATG33	Q06485	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	ARV1	Q06541	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SRL2	Q12020	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	MED2	Q12124	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	BSC1	Q12140	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	REP1	P03871	373 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	MRP13	P12686	339 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	MER1	P16523	270 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YCL049C	P25577	312 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	HOT13	P36078	116 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YBL029W	P38201	376 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	TVP15	Q03860	143 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	API2	Q04413	109 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	VPS36	Q06696	566 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	IRC19	Q07843	230 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	DBF2	P22204	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	SLC1	P33333	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	YKL102C	P34249	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	MTC6	P38849	526 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	YER121W	P40076	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	PTR3	P43606	678 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	SSN8	P47821	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	SIP18	P50263	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	CRZ1	P53968	678 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
BRL1	YHR036W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	RCE1	Q03530	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	RAD30	Q04049	632 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	MCP1	Q12106	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	PCL2	P25693	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	PEX6	P33760	1030 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	FZO1	P38297	855 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	ECM34	P38728	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	ECM14	P38836	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	GAB1	P41733	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	YGR126W	P53274	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	IZH3	Q07959	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	MSA1	Q08471	629 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	GRE1	Q08969	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	RPN6	Q12377	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	ERP4	Q12450	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	CLB3	P24870	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	VPH2	P32341	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	BIG1	P38813	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	YIR020C	P40575	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	YGL117W	P53133	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	CPR8	P53728	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	SET6	Q12529	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	PDE2	P06776	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	PUT2	P07275	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	ERD2	P18414	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	PTC1	P35182	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	FRE2	P36033	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	TSC10	P38342	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	MRX1	P40050	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	POP1	P41812	875 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	EGT2	P42835	1041 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	IMA1	P53051	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	SKO1	Q02100	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	MDM36	Q06820	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	CRT10	Q08226	957 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	JLP1	Q12358	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	RTR2	Q12378	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	MSI1	P13712	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	SCO1	P23833	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	YKL063C	P35725	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRL1	YHR036W	ROT2	P38138	954 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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