RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	2.32	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	YGL088W	P53151	121 aa		2.32	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	YGR266W	P53326	701 aa		2.32	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	YPL113C	Q02961	396 aa		2.32	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	OPI1	P21957	404 aa		2.31	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	YCR025C	P25352	136 aa		2.31	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	MRPL6	P32904	214 aa		2.31	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	YPC1	P38298	316 aa		2.31	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	MED8	P38304	223 aa		2.31	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	OKP1	P53298	406 aa		2.31	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	ABZ2	Q03266	374 aa		2.31	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	MIX17	Q03667	156 aa		2.31	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	YLR297W	Q05899	129 aa		2.31	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	2.31	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	UTR5	P32630	166 aa		2.3	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	AIM29	P36154	155 aa		2.3	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	SWC5	P38326	303 aa		2.3	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	MRX4	Q12467	430 aa		2.3	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	KRE1	P17260	313 aa		2.29	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	MCH2	P36032	473 aa		2.29	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	YER084W	P40057	128 aa		2.29	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	UFD1	P53044	361 aa		2.29	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	YLR446W	Q06204	433 aa		2.29	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		2.29	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	YAK1	P14680	807 aa		2.28	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	IMP1	P28627	190 aa		2.28	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	TPO5	P36029	618 aa		2.28	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	SSO2	P39926	295 aa		2.28	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	VPS20	Q04272	221 aa		2.28	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	2.28	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	2.28	□□□□□ -2.04
RSM27	YGR215W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	SWC4	P53201	476 aa		2.27	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	IZH4	Q99393	312 aa		2.27	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	RAD7	P06779	565 aa		2.26	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	YKR032W	P36127	104 aa		2.26	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	YER188W	P40103	239 aa		2.26	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	UBC13	P52490	153 aa		2.26	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	OSH6	Q02201	448 aa		2.26	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	APC9	Q12107	265 aa		2.26	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	VPH2	P32341	215 aa		2.25	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	PES4	P39684	611 aa		2.25	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	YFL064C	P43540	174 aa		2.25	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	TAZ1	Q06510	381 aa		2.25	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	FEX1	Q08913	375 aa		2.25	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	FEX2	Q08991	375 aa		2.25	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	YOL163W	P0CF20	169 aa		2.24	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	IFM1	P25038	676 aa		2.24	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	PET18	P25362	215 aa		2.24	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	MRPL3	P36516	390 aa		2.24	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	SCC4	P40090	624 aa		2.24	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	OSW5	P40219	148 aa		2.24	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	GDS1	P41913	522 aa		2.24	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	MED6	P38782	295 aa		2.23	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	POP2	P39008	433 aa		2.23	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	VAB2	P40003	282 aa		2.23	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	KRE29	P40026	464 aa		2.23	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	SYS1	P41544	203 aa		2.23	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	MRS2	Q01926	470 aa		2.23	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	NNT1	Q05874	261 aa		2.23	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	PEX30	Q06169	523 aa		2.23	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	YPR064W	Q12492	139 aa		2.23	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	STF1	P01098	86 aa		2.22	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	YHL044W	P38727	235 aa		2.22	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	MIG2	P53035	382 aa		2.22	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	LIF1	P53150	421 aa		2.22	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	VOA1	P53262	265 aa		2.22	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	BIO4	P53630	237 aa		2.22	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	RGM1	Q00453	211 aa		2.22	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	REX3	Q12090	404 aa		2.22	□□□□□ -2.05
RSM27	YGR215W	PHO80	P20052	293 aa		2.21	□□□□□ -2.06
RSM27	YGR215W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
RSM27	YGR215W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
RSM27	YGR215W	AVT6	P40074	448 aa		2.21	□□□□□ -2.06
RSM27	YGR215W	AVT7	P40501	490 aa		2.21	□□□□□ -2.06
RSM27	YGR215W	CUR1	Q06469	252 aa		2.21	□□□□□ -2.06
RSM27	YGR215W	CDD1	Q06549	142 aa		2.21	□□□□□ -2.06
RSM27	YGR215W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
RSM27	YGR215W	PRR2	Q12310	699 aa		2.21	□□□□□ -2.06
RSM27	YGR215W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	2.2	□□□□□ -2.06

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