RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W MNN9P39107 395 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W DBP6P53734 629 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W CSI1Q04368 295 aa2.25□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W YLR446WQ06204 433 aa2.25□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W SIA1Q12212 622 aa2.25□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W CDC13P32797 924 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W RRG8Q06109 277 aa2.24□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W CUR1Q06469 252 aa2.24□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W YPL264CQ08980 353 aa2.24□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W YPR096CO13587 100 aa2.23□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W VPH2P32341 215 aa2.23□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W RPN14P53196 417 aa2.23□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W VAC14Q06708 880 aa2.23□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W APC9Q12107 265 aa2.23□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W YPR063CQ12160 140 aa2.23□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W IES3Q12345 250 aa2.23□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W RPS23BP0CX30 145 aa2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W ARO4P32449 370 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W GCG1P32656 232 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W RPC25P35718 212 aa2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W GPX1P36014 167 aa2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W TPO5P36029 618 aa2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W ECM14P38836 430 aa2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W TDA11P38854 504 aa2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W YFL064CP43540 174 aa2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W UBC13P52490 153 aa2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W LIF1P53150 421 aa2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W BIO4P53630 237 aa2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W ACT1P60010 375 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W YPL278CQ08990 100 aa2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W YPR064WQ12492 139 aa2.22□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YPC1P38298 316 aa2.21□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W MED8P38304 223 aa2.21□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W SPO73P40031 143 aa2.21□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W ECO1P43605 281 aa2.21□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W KEL2P50090 882 aa2.21□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YPL077CQ02831 240 aa2.21□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W DAL5P15365 543 aa2.2□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W VPS1P21576 704 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W IMP1P28627 190 aa2.2□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YKL063CP35725 167 aa2.2□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W KRE29P40026 464 aa2.2□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YIL012WP40551 113 aa2.2□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YFR045WP43617 309 aa2.2□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W PRP24P49960 444 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W ARP5P53946 755 aa2.2□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W DIA1P54005 336 aa2.2□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W ASR1Q06834 288 aa2.2□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W MRPL3P36516 390 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YBR062CP38239 180 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W RRF1P38771 230 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W VAB2P40003 282 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W PCL7P40186 285 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YIA6P40556 373 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W GDS1P41913 522 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YJL144WP47009 104 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W MPP10P47083 593 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W GTO1P48239 356 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W UFD1P53044 361 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YDR114CQ04597 100 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W GTO3Q04806 366 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YDR222WQ04925 415 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W PEX30Q06169 523 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W DXO1Q06349 442 aa2.19□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YAK1P14680 807 aa2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W UGA1P17649 471 aa2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W DAL81P21657 970 aa2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W GPI12P23797 304 aa2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W CSM1P25651 190 aa2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W TKL2P33315 681 aa2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W RPC37P36121 282 aa2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YPT32P51996 222 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W SPO19Q03029 223 aa2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YMR209CQ03648 457 aa2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W NNT1Q05874 261 aa2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W GPN3Q06543 272 aa2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W BER1Q06688 274 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W MRX4Q12467 430 aa2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa2.18□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W ATP6P00854 259 aa2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W TFS1P14306 219 aa2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W PRE7P23724 241 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W DAL80P26343 269 aa2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W AEP1P32493 518 aa2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.2 ms