RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	NDT80	P38830	627 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	TAD2	P47058	250 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	TIS11	P47977	285 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	CRZ1	P53968	678 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	OST6	Q03723	332 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	VBA1	Q04301	562 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	GAS2	Q06135	555 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RIF2	Q06208	395 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	ICT1	Q12385	394 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	GIS3	Q12418	502 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	PRM4	Q12498	284 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	PDC2	P32896	925 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	CSE1	P33307	960 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	AIM29	P36154	155 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	SIP3	P38717	1229 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	DDI1	P40087	428 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	GDS1	P41913	522 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	MOB2	P43563	287 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	UBC13	P52490	153 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	SHY1	P53266	389 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	GIM3	P53900	129 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	SUR7	P54003	302 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	KRE28	Q04431	385 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	TAF10	Q12030	206 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	PPT2	Q12036	173 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	MSH5	Q12175	901 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YPR064W	Q12492	139 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YOS9	Q99220	542 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	SPS100	P13130	326 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	TFS1	P14306	219 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	INO2	P26798	304 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	DEP1	P31385	405 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	MRPL6	P32904	214 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YPC1	P38298	316 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YFR057W	P43625	151 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	KTR6	P54070	446 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	FSH2	Q05015	223 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	CBS2	P14905	389 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	CPR3	P25719	182 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	PPA2	P28239	310 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	LDS1	P31379	325 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	LDB7	P38210	180 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	HIT1	P46973	164 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	AIM23	P47015	356 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.75	□□□□□ -1.81	not detected
CMR3	YPR013C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	PBA1	Q05778	276 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	ATP16	Q12165	160 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	REV1	P12689	985 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	MER1	P16523	270 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	MRPL25	P23369	157 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	URA10	P30402	227 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	PMT2	P31382	759 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	IES6	P32617	166 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	PEX22	P39718	180 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	EGT2	P42835	1041 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YPR172W	Q06608	200 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	MFG1	Q07684	458 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	TIP41	Q12199	356 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	SFM1	Q12314	213 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	JID1	Q12350	301 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	TFC7	Q12415	435 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	POF1	P25576	258 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	CSE2	P33308	149 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	VHT1	P53241	593 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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