RNA–Protein interactions for RNA: YOR209C

NPT1, Transcript of Nicotinate phosphoribosyltransferase, yeast

Gene NPT1, Length 1,290 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NPT1	YOR209C	RGT2	Q12300	763 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	ARP6	Q12509	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
NPT1	YOR209C	SPO12	P17123	173 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	PPZ1	P26570	692 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	ADE1	P27616	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	PDR3	P33200	976 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	APD1	P38281	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	YHR035W	P38769	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	DDI1	P40087	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	CSM2	P40465	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	YNR048W	P53740	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	RTC4	P53850	401 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	SPR6	Q01684	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	BET5	Q03630	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	CDC123	Q05791	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	YDL144C	Q07589	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	DSE3	Q08729	430 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	APC9	Q12107	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	TIP41	Q12199	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	RKM5	Q12367	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	CBF1	P17106	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	CSE1	P33307	960 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	ATG7	P38862	630 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	HAT2	P39984	401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	SLM1	P40485	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	KEG1	P43614	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	TAD2	P47058	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	MSS11	Q03825	758 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	BNA5	Q05979	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	ATG17	Q06410	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	SNF8	Q12483	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPT1	YOR209C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	SPO11	P23179	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	MKK1	P32490	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	IES6	P32617	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	ZRT1	P32804	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	PPZ2	P33329	710 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	RSM22	P36056	628 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	YCR041W	P37265	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	MIC12	P38341	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	RCK2	P38623	610 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	ERG28	P40030	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	YJL043W	P47053	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	HOC1	P47124	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	YPT11	P48559	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	PHB2	P50085	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	STB4	P50104	949 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	GET1	P53192	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	FRE4	P53746	719 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	NUP100	Q02629	959 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	OST6	Q03723	332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	TMN2	Q04562	672 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	DIC1	Q06143	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	IRC10	Q08118	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	ACF2	Q12168	779 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	NCA2	Q12374	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	IZH4	Q99393	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	YMR31	P19955	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	NDC1	P32500	655 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	YEF1	P32622	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	YKL063C	P35725	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	COX15	P40086	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	IDP2	P41939	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	SCS3	P53012	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	CAC2	Q04199	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	YMR321C	Q04898	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	FAR8	Q05040	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	ASR1	Q06834	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	NDE2	Q07500	545 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	YCR100C	P25606	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPT1	YOR209C	MRPL6	P32904	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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