RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	YBR053C	P38235	358 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	ECM8	P38246	354 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	DER1	P38307	211 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	CYC2	P38909	366 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	PHM8	P40025	321 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	YPS6	P40583	537 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	YGR210C	P42942	411 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	HOC1	P47124	396 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	UBC11	P52492	156 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	YLR460C	P54007	376 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	NUP53	Q03790	475 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	PLB3	Q08108	686 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	THP1	Q08231	455 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	OPI3	P05375	206 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	FUB1	P25659	250 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	NUP2	P32499	720 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	YKL063C	P35725	167 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	SHG1	P38337	142 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	TVP23	P38962	199 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	DDI1	P40087	428 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	IDP2	P41939	412 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	SFH5	P47008	294 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	YGL235W	P53071	178 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	SUN4	P53616	420 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	ATG4	P53867	494 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	SED5	Q01590	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	TMN2	Q04562	672 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	MLH3	Q12083	715 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	JLP1	Q12358	412 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	TRM13	Q12383	476 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	ECM29	P38737	1868 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YMD8	YML038C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	MXR2	P25566	168 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	CTP1	P38152	299 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	SEN34	P39707	275 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	FMP52	P40008	231 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YIR016W	P40572	265 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YFR057W	P43625	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	CIN2	P46670	268 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	TAD2	P47058	250 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	NAS6	P50086	228 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	NIF3	P53081	288 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	GND2	P53319	492 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	RCF2	P53721	224 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	RSM23	Q01163	450 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	TMS1	Q12116	473 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ACF2	Q12168	779 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ARP6	Q12509	438 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ITR2	P30606	609 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	CBP4	P37267	147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	RIB5	P38145	238 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	MRX3	P38172	270 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	OPY1	P38271	328 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ATG7	P38862	630 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ALG8	P40351	577 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	SAS2	P40963	338 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	COS4	P43542	379 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YJR030C	P47101	745 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	PMT5	P52867	743 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	OKP1	P53298	406 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	IBD2	P53892	351 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	FYV6	P53913	173 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	RMI1	Q02685	241 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	CSM3	Q04659	317 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	NAT4	Q04751	285 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	DXO1	Q06349	442 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36 ms