RNA–Protein interactions for RNA: YML007W

YAP1, Transcript of Basic leucine zipper (bZIP) transcription factor, yeast

Gene YAP1, Length 1,953 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YAP1	YML007W	COS10	P52924	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YNR062C	P53748	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	SWA2	Q06677	668 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
YAP1	YML007W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	PRB1	P09232	635 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	SBE22	P38814	852 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	RRG9	P40156	214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	NIT2	P47016	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	MSY1	P48527	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YGR126W	P53274	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YNL092W	P53934	400 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	ASI1	P54074	624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	SIA1	Q12212	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	VCX1	Q99385	411 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	TPK3	P05986	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	PHO80	P20052	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YCR100C	P25606	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	PTP2	P29461	750 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YBR096W	P38256	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	STB1	P42845	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	PRY1	P47032	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	MNT4	P53745	580 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	RCN2	Q12044	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	SPC3	Q12133	184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	WTM2	Q12206	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	SIR3	P06701	978 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	MCM1	P11746	286 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	MDH2	P22133	377 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	ECM8	P38246	354 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YBR138C	P38277	524 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	CHL4	P38907	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	SWP82	P43554	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	HMS2	P47175	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	SNF12	P53628	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	HOT1	Q03213	719 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	RAF1	Q06891	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	BTS1	Q12051	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	MSW1	P04803	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	SEC12	P11655	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	CNA1	P23287	553 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	PTC6	P25646	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	KRE6	P32486	720 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YME2	P32843	850 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	RPP1	P38786	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	ECM1	P39715	212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YIL169C	P40442	995 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	HIS6	P40545	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	IRC5	P43610	853 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	SSY5	P47002	699 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	TYW3	P53177	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	BUD9	P53226	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	PET191	Q02772	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	SMP3	Q04174	516 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	CRR1	Q05790	422 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YRM1	Q12340	786 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	STE50	P25344	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	OAC1	P32332	324 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
YAP1	YML007W	YKL077W	P36081	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	KRE29	P40026	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	BUR6	P40096	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YRB2	P40517	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	MPH1	P40562	993 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	RET2	P43621	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YMD8	Q03697	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	RNH1	Q04740	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	ELP6	Q04868	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YAP1	YML007W	ACF2	Q12168	779 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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