RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP2	YHR167W	ERV41	Q04651	352 aa		3	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	ERP4	Q12450	207 aa		3	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	PEX11	Q12462	236 aa		3	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	GPA2	P10823	449 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	CYM1	P32898	989 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	SKN1	P33336	771 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	CAB3	P36076	571 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	MRP21	P38175	177 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	YBR062C	P38239	180 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	YDR089W	P38966	869 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	COX14	P39103	70 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	PEP8	P40335	379 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	TOS2	P50078	622 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	MRM2	P53123	320 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	SHY1	P53266	389 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	PET117	Q02771	107 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	SEC10	Q06245	871 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	ATG10	Q07879	167 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	YLR012C	Q07927	99 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	YLR046C	Q12253	270 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	RNH203	Q12338	110 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	IZH2	Q12442	317 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	OCA6	Q12454	224 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	RGS2	Q99188	309 aa		2.99	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	NAM2	P11325	894 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	MRPL8	P22353	238 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	TOA1	P32773	286 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	HSM3	P38348	480 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	YHI9	P38765	294 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	AIM23	P47015	356 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	PMT5	P52867	743 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	NBP35	P52920	328 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	MTQ1	P53944	314 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	PIR1	Q03178	341 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	FAR8	Q05040	523 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	CDC123	Q05791	360 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	NDL1	Q06568	189 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	NSE1	Q07913	336 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	ECM29	P38737	1868 aa		2.98	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	MSI1	P13712	422 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	NMT1	P14743	455 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	MNE1	P24720	663 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.97	□□□□□ -1.93	not detected
THP2	YHR167W	PTM1	P32857	523 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	QDR3	P38227	689 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	MMS21	P38632	267 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	YHK8	P38776	514 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	HEM14	P40012	539 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	GAB1	P41733	394 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	LCB3	P47013	409 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	ROG1	P53118	685 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	SWC4	P53201	476 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	CLD1	P53264	445 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	YNL260C	P53846	198 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	MEH1	Q02205	184 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	NHP10	Q03435	203 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	YMR010W	Q03687	405 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	TSA2	Q04120	196 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	RIF2	Q06208	395 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	YLR177W	Q06251	628 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	NDE2	Q07500	545 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THP2	YHR167W	STE2	D6VTK4	431 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	OPI3	P05375	206 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.96	□□□□□ -1.94	not detected
THP2	YHR167W	PHO91	P27514	894 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	AEP1	P32493	518 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	NUP2	P32499	720 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	YEF1	P32622	495 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	YHR182W	P38870	785 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	FMP32	P43557	207 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	STE24	P47154	453 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	AIF1	P52923	378 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	BOL2	P53082	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	MET31	Q03081	177 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	TDA1	Q03533	586 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THP2	YHR167W	GOT1	Q03554	138 aa		2.96	□□□□□ -1.94

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