RNA–Protein interactions for RNA: YHR134W

WSS1, Transcript of Metalloprotease involved in DNA repair, removes DNA-protein crosslinks at stalled replication forks during replication of damaged DNA, yeast

Gene WSS1, Length 810 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSS1	YHR134W	FRT2	P39734	528 aa		4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	VAB2	P40003	282 aa		4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	EFM3	P47163	339 aa		4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YGL159W	P53110	370 aa		4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	RCF2	P53721	224 aa		4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YNL143C	P53908	130 aa		4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	SKO1	Q02100	647 aa		4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	TAF12	Q03761	539 aa		4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	VAM3	Q12241	283 aa		4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	ORT1	Q12375	292 aa		4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	RTR2	Q12378	196 aa		4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	RMD5	Q12508	421 aa		4.06	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	VPS63	O13549	108 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	ZRC1	P20107	442 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	CSM1	P25651	190 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	BEM1	P29366	551 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	TCA17	P32613	152 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	PRM5	P40476	318 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	SNL1	P40548	159 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	AGP3	P43548	558 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YJR056C	P47115	236 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	HXT11	P54862	567 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	MMT1	Q03218	510 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YMD8	Q03697	442 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	ROY1	Q04847	553 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YFH1	Q07540	174 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	AKR2	Q12013	749 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	BTS1	Q12051	335 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	SNF8	Q12483	233 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	BUD3	P25558	1636 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	MHP1	P43638	1398 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	SPO14	P36126	1683 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	SCEI	P03882	235 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YCL068C	P25593	260 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	HSP30	P25619	332 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	ERV1	P27882	189 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YEL045C	P32616	141 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	VAM7	P32912	316 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	SRL3	P36167	246 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	MRPL4	P36517	319 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	FZO1	P38297	855 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YGL114W	P53134	725 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	OKP1	P53298	406 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	FRE4	P53746	719 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YDC1	Q02896	317 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	APC4	Q04601	652 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	CSM4	Q08955	156 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	IES3	Q12345	250 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.76	not detected
WSS1	YHR134W	MAS1	P10507	462 aa		4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	URA4	P20051	364 aa		4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	PEX3	P28795	441 aa		4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	SPR1	P32603	445 aa		4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YBR137W	P38276	179 aa		4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YAL037W	P39728	267 aa		4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	HPM1	P40481	377 aa		4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	YHC3	P47040	408 aa		4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	ILM1	P47155	203 aa		4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	SDT1	P53078	280 aa		4.03	□□□□□ -1.76
WSS1	YHR134W	RTT102	P53330	157 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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