RNA–Protein interactions for RNA: YLR250W

SSP120, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene SSP120, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP120	YLR250W	YER084W	P40057	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MPM1	P40364	252 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	NUP57	P48837	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YNR062C	P53748	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YNL033W	P53964	284 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YNL019C	P53975	284 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RSM28	Q03430	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RCE1	Q03530	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	AGE1	Q04412	482 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RNH202	Q05635	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SWA2	Q06677	668 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	HRT1	Q08273	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RTN2	Q12443	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SIR3	P06701	978 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SEC12	P11655	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	GIT1	P25346	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	DAL80	P26343	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MRP8	P35719	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YKL077W	P36081	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MRPL16	P38064	232 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	ECM14	P38836	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YHR218W	P38899	603 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YEL068C	P39977	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YIL029C	P40538	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MRPL19	P53875	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SED1	Q01589	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	COQ10	Q08058	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RRT8	Q08219	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TSC13	Q99190	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	DYN1	P36022	4092 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RAS1	P01119	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
SSP120	YLR250W	TOA1	P32773	286 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SLC1	P33333	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	LTV1	P34078	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
SSP120	YLR250W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	VHR1	P40522	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	IAH1	P41734	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	GDS1	P41913	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SIP18	P50263	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	CRZ1	P53968	678 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	CIK1	Q01649	594 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	GGA1	Q06336	557 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SYO1	Q07395	620 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	THP1	Q08231	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MUM3	Q08750	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SFM1	Q12314	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RAD7	P06779	565 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	PPA2	P28239	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	PEX3	P28795	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
SSP120	YLR250W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SNC1	P31109	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	THI4	P32318	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	JEN1	P36035	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SRO77	P38163	1010 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	PEX18	P38855	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	PIG2	P40187	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MTM1	P53320	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	CTS2	Q06350	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	GPI11	Q06636	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	ASA1	Q06822	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MRX4	Q12467	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	CCW14	O13547	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSP120	YLR250W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSP120	YLR250W	NUP1	P20676	1076 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSP120	YLR250W	SED4	P25365	1065 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSP120	YLR250W	TRS65	P32893	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSP120	YLR250W	NUF2	P33895	451 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSP120	YLR250W	YKL107W	P34251	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSP120	YLR250W	ECM15	P35195	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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