RNA–Protein interactions for RNA: YJL174W

KRE9, Transcript of Glycoprotein involved in cell wall beta-glucan assembly, yeast

Gene KRE9, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KRE9	YJL174W	ATG31	Q12421	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
KRE9	YJL174W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	YSR3	P23501	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	GPX2	P38143	162 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	CHK1	P38147	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	YHK8	P38776	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	FLO5	P38894	1075 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	ABM1	P47146	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	NDE2	Q07500	545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	BSC6	Q08280	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	YOS9	Q99220	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	RAD3	P06839	778 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	DAL82	P21705	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	MEI5	P32489	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	SRB4	P32569	687 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	TMT1	P32643	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	YKL071W	P36086	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	ALG8	P40351	577 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	AZF1	P41696	914 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	AGP3	P43548	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	YJL118W	P47022	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	GAT3	Q07928	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	YJL174W	ATP6	P00854	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	PRB1	P09232	635 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	MDM10	P18409	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	GLN3	P18494	730 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	SLY1	P22213	666 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	PRR1	P28708	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	KRE6	P32486	720 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	AIM29	P36154	155 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	SIP3	P38717	1229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YHR035W	P38769	630 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	AIM24	P47127	394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	KTR6	P54070	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	STP1	Q00947	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	SED5	Q01590	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	CSM3	Q04659	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	RIM15	P43565	1770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	SIR4	P11978	1358 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	ATR1	P13090	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	RRT12	P25381	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	RAD51	P25454	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YCR022C	P25620	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	POP5	P28005	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	RIB5	P38145	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YCH1	P42937	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	IKS1	P47042	667 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	MRPL50	P53724	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	COS1	P53822	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	CAF40	P53829	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	PAM18	Q07914	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	ERP3	Q12403	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	ARG80	P07249	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	TDA11	P38854	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	RTT101	P47050	842 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	IBD2	P53892	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	HXT11	P54862	567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	IRC4	Q03036	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	PIR3	Q03180	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	MDM36	Q06820	579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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