RNA–Protein interactions for RNA: YHR104W

GRE3, Transcript of Aldose reductase, yeast

Gene GRE3, Length 984 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GRE3	YHR104W	BIO3	P50277	480 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	SCS3	P53012	380 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CGR1	P53188	120 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	BSC6	Q08280	497 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	ESA1	Q08649	445 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	FCY22	Q12119	530 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	HMS1	Q12398	434 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	HEM4	P06174	275 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	ZIP1	P31111	875 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	FUN26	P31381	517 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	SRB4	P32569	687 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	DOA4	P32571	926 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CYM1	P32898	989 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	SDH3	P33421	198 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	YKL071W	P36086	256 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	DTR1	P38125	572 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	SMF2	P38778	549 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	MET5	P47169	1442 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	MRPL50	P53724	139 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	WSC2	P53832	503 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	TDA1	Q03533	586 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	DDC1	Q08949	612 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	TRP1	P00912	224 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CTA1	P15202	515 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	DAL82	P21705	255 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CWP1	P28319	239 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	YKL063C	P35725	167 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	PRM5	P40476	318 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	YFL040W	P43562	540 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	TIM21	P53220	239 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	INP2	Q03824	705 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	GRS2	Q06817	618 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	ASR1	Q06834	288 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	HNT3	Q08702	217 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	SSK2	P53599	1579 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CYC3	P06182	269 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	NAM2	P11325	894 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CPR4	P25334	318 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	RRT12	P25381	491 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	NUP2	P32499	720 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	MSS2	P40990	351 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	IDP2	P41939	412 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CIN2	P46670	268 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	SWC4	P53201	476 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CLD1	P53264	445 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	MTM1	P53320	366 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	PGA2	P53903	129 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	SNX41	Q04053	625 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	ATG31	Q12421	196 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CDC25	P04821	1589 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	RPB5	P20434	215 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	KRE6	P32486	720 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
GRE3	YHR104W	SLM1	P40485	686 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	YIA6	P40556	373 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	PMT4	P46971	762 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	CRZ1	P53968	678 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	TRM82	Q03774	444 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	PAM18	Q07914	168 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GRE3	YHR104W	REP1	P03871	373 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GRE3	YHR104W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
GRE3	YHR104W	RPC37	P36121	282 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GRE3	YHR104W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
GRE3	YHR104W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
GRE3	YHR104W	COA1	P40452	197 aa		4.21	□□□□□ -1.74

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