RNA–Protein interactions for RNA: YGL158W

RCK1, Transcript of Protein kinase involved in the response to oxidative stress, yeast

Gene RCK1, Length 1,539 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RCK1	YGL158W	VPS13	Q07878	3144 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	HEM15	P16622	393 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	TMT1	P32643	299 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	COT1	P32798	439 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	COY1	P34237	679 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	AST1	P35183	429 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	SIM1	P40472	476 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	LAM5	P43560	674 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	LOH1	P47055	219 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	AVT4	P50944	713 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	YKR005C	Q02203	525 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	FMN1	Q03778	218 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	LDB17	Q12342	491 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	YOP1	Q12402	180 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	YOR338W	Q99326	363 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	TAO3	P40468	2376 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	YAK1	P14680	807 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	GLN3	P18494	730 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	YCL068C	P25593	260 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	MNS1	P32906	549 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	FES1	P38260	290 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	MST28	P39552	234 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	HAT2	P39984	401 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	STB1	P42845	420 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	POP6	P53218	158 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	RRN9	P53437	365 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	SPR6	Q01684	191 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	IES4	Q08561	116 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK1	YGL158W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	MXR2	P25566	168 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YCR022C	P25620	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	TPO5	P36029	618 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	SLX1	P38324	304 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	MIG2	P53035	382 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	USE1	P53146	245 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	ORM1	P53224	222 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	OSH6	Q02201	448 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	SEG1	Q04279	960 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	ECM29	P38737	1868 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	UNG1	P12887	359 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	CBF1	P17106	351 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	MRPL8	P22353	238 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	VAM7	P32912	316 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	KKQ8	P36004	724 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YHL026C	P38740	315 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YIR016W	P40572	265 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	RRT5	P43607	289 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	MDV1	P47025	714 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	ATC1	Q04005	294 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YMR027W	Q04371	470 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	NAT4	Q04751	285 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	COQ11	Q05892	277 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	BUR2	Q05949	395 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	APC5	Q08683	685 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	MRX3	P38172	270 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	POP4	P38336	279 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	FET3	P38993	636 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	SHO1	P40073	367 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	IKS1	P47042	667 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YDR278C	Q05612	105 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YPL199C	Q08954	240 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	COX4	P04037	155 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YFL068W	P0CX99	160 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YEF1	P32622	495 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	MRPS5	P33759	307 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	PET100	P38958	111 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	FAA2	P39518	744 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	SRL4	Q03085	281 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	PIR3	Q03180	325 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	RIM13	Q03792	727 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	YLL007C	Q07799	665 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RCK1	YGL158W	FMP16	Q12497	93 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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