RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502575.1

PDE4D-209, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-209ENST00000502575 CEP63Q96MT8 703 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 MTA3Q9BTC8 594 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 OSBPL7Q9BZF2 842 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 CERS4Q9HA82 394 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 MLXIPQ9HAP2 919 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 SLC28A3Q9HAS3 691 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 SLC12A7Q9Y666 1083 aa10.02□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 SMARCA1P28370 1054 aa10.01□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 DEFB103AP81534 67 aa10.01□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 ZNF618Q5T7W0 954 aa10.01□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 GPR20Q99678 358 aa10.01□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 H3BRB1 525 aa10□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 TREHO43280 583 aa10□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 FIBPO43427 364 aa10□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa10□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 CALM1P0DP23 149 aa10□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 CALM3P0DP25 149 aa10□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 ACTN1P12814 892 aa10□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 HOXC8P31273 242 aa10□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 METTL7BQ6UX53 244 aa10□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 VRTNQ9H8Y1 702 aa10□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 WDFY4Q6ZS81 3184 aa10□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.99□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 STAM2O75886 525 aa9.99□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 CDC27P30260 824 aa9.99□□□□□ -0.81
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PDE4D-209ENST00000502575 SETD4Q9NVD3 440 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 ZBTB43O43298 467 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 ADAM23O75077 832 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 BAIAP3O94812 1187 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 KCNJ6P48051 423 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 NAPAP54920 295 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 APOBRQ0VD83 1088 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 NEDD9Q14511 834 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-209ENST00000502575 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.98□□□□□ -0.81
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