RNA–Protein interactions for RNA: YJR069C

HAM1, Transcript of Nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, yeastyeast

Gene HAM1, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAM1YJR069C SUI2P20459 304 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HAM1YJR069C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C SET1P38827 1080 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C THI12P42883 340 aa9.57□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C THI5P43534 340 aa9.57□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C THI11P47183 340 aa9.57□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C PIB1Q06651 286 aa9.57□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C THI13Q07748 340 aa9.57□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C PRD1P25375 712 aa9.56□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C CSE4P36012 229 aa9.55□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C FKS3Q04952 1785 aa9.55□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C COQ8P27697 501 aa9.54□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data9.54□□□□□ -0.88not detected
HAM1YJR069C THI22Q06490 572 aa9.54□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C URB1P34241 1764 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C SIR4P11978 1358 aa9.53□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C SAP155P43612 1002 aa9.53□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C YRF1-4O13559 1382 aa9.52□□□□□ -0.88
HAM1YJR069C PAP2P53632 584 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HAM1YJR069C HEF3P53978 1044 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HAM1YJR069C GAS4Q08271 471 aa9.51□□□□□ -0.89
HAM1YJR069C DPS1P04802 557 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HAM1YJR069C MIF2P35201 549 aa9.5□□□□□ -0.89
HAM1YJR069C FUN12P39730 1002 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HAM1YJR069C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HAM1YJR069C GTT3P39996 337 aa9.49□□□□□ -0.89
HAM1YJR069C TPD3P31383 635 aa9.48□□□□□ -0.89
HAM1YJR069C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HAM1YJR069C EDS1P38073 919 aa9.46□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C RTT109Q07794 436 aa9.46□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C YIL092WP40497 633 aa9.43□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data9.43□□□□□ -0.9not detected
HAM1YJR069C YPR148CQ06523 435 aa9.43□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data9.42□□□□□ -0.9not detected
HAM1YJR069C DSD1P53095 428 aa9.42□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C YNL050CP53952 270 aa9.42□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C RAD2P07276 1031 aa9.41□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C PRP5P21372 849 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C PTC3P34221 468 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C FPR3P38911 411 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C SAM3Q08986 587 aa9.41□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C SLM3Q12093 417 aa9.41□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C NTH2P35172 780 aa9.4□□□□□ -0.9
HAM1YJR069C EDE1P34216 1381 aa9.39□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C CTF4Q01454 927 aa9.38□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C MAM1P40065 302 aa9.37□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C DAL5P15365 543 aa9.36□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C UBP9P39967 754 aa9.36□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C GYP7P48365 746 aa9.36□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C RSF2P46974 1380 aa9.36□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C YRF1-3P0CX14 1859 aa9.35□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C YRF1-7P0CX15 1859 aa9.35□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C POL32P47110 350 aa9.35□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C VPS70P47161 811 aa9.35□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C YRF1-6P53819 1859 aa9.35□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C LYS2P07702 1392 aa9.35□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C RPC31P17890 251 aa9.34□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C HSP104P31539 908 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C ZDS1P50111 915 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HAM1YJR069C AOS1Q06624 347 aa9.33□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C YOL036WQ08206 761 aa9.33□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C TCB1Q12466 1186 aa9.33□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C RRT14P40470 206 aa9.32□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C WSC3Q12215 556 aa9.32□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C XKS1P42826 600 aa9.31□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C ATH1P48016 1211 aa9.31□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C SRT1Q03175 343 aa9.31□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C MSB4Q12317 492 aa9.31□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C GYP5Q12344 894 aa9.31□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C UGA3P26370 528 aa9.29□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C GUT1P32190 709 aa9.29□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C YBL029C-AQ3E756 94 aa9.29□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C NUP145P49687 1317 aa9.29□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C SET4P42948 560 aa9.28□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C INP54Q08227 384 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HAM1YJR069C COQ4O13525 335 aa9.27□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C TRP5P00931 707 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C KCC4P25389 1037 aa9.27□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C YPP1P46951 817 aa9.27□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C PUF6Q04373 656 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C YIR014WP40570 242 aa9.26□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C VNX1P42839 908 aa9.26□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C NSE3Q05541 303 aa9.26□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C RPS19AP07280 144 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C OPY1P38271 328 aa9.23□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C CSI1Q04368 295 aa9.23□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C YOL057WQ08225 711 aa9.23□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C ENT1Q12518 454 aa9.23□□□□□ -0.93
HAM1YJR069C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 102.2 ms