RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDI1	YER143W	BBC1	P47068	1157 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDI1	YER143W	ENV9	Q08651	330 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDI1	YER143W	AI2	P03876	854 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDI1	YER143W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
DDI1	YER143W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
DDI1	YER143W	YDL144C	Q07589	356 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDI1	YER143W	TCB1	Q12466	1186 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDI1	YER143W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
DDI1	YER143W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.41	□□□□□ -0.58	not detected
DDI1	YER143W	XKS1	P42826	600 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDI1	YER143W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
DDI1	YER143W	SIR4	P11978	1358 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDI1	YER143W	PRD1	P25375	712 aa		11.4	□□□□□ -0.58
DDI1	YER143W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
DDI1	YER143W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
DDI1	YER143W	DSD1	P53095	428 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDI1	YER143W	YLR271W	Q06152	274 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDI1	YER143W	THI22	Q06490	572 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDI1	YER143W	RCR1	P38212	213 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDI1	YER143W	IES2	P40154	320 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDI1	YER143W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DDI1	YER143W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
DDI1	YER143W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
DDI1	YER143W	CDC45	Q08032	650 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDI1	YER143W	NTH2	P35172	780 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDI1	YER143W	SAP155	P43612	1002 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DDI1	YER143W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
DDI1	YER143W	RTT109	Q07794	436 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DDI1	YER143W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
DDI1	YER143W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
DDI1	YER143W	CTF4	Q01454	927 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DDI1	YER143W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
DDI1	YER143W	YNL050C	P53952	270 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DDI1	YER143W	MST1	P07236	462 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDI1	YER143W	TPD3	P31383	635 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDI1	YER143W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DDI1	YER143W	NUP145	P49687	1317 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDI1	YER143W	YKL133C	P36066	463 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDI1	YER143W	DOT5	P40553	215 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDI1	YER143W	AOS1	Q06624	347 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDI1	YER143W	SSP1	P38871	571 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDI1	YER143W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DDI1	YER143W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DDI1	YER143W	RIM15	P43565	1770 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DDI1	YER143W	MEC3	Q02574	474 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDI1	YER143W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DDI1	YER143W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.23	□□□□□ -0.61	not detected
DDI1	YER143W	YOR238W	Q08634	303 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDI1	YER143W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDI1	YER143W	EDE1	P34216	1381 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	MAM1	P40065	302 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	LYS2	P07702	1392 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	COB	P00163	385 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	KCC4	P25389	1037 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	YKR075C	P36155	307 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	GYP7	P48365	746 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.19	□□□□□ -0.62	not detected
DDI1	YER143W	RRT14	P40470	206 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	UGA3	P26370	528 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	YMR074C	Q04773	145 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	COQ4	O13525	335 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	YIL092W	P40497	633 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	YAP5	P40574	245 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	SRT1	Q03175	343 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDI1	YER143W	ATG13	Q06628	738 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDI1	YER143W	NSE3	Q05541	303 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDI1	YER143W	ALE1	Q08548	619 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDI1	YER143W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDI1	YER143W	YBR287W	P38355	427 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDI1	YER143W	YBP2	P53169	641 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDI1	YER143W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDI1	YER143W	DAL5	P15365	543 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDI1	YER143W	NPR2	P39923	615 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDI1	YER143W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDI1	YER143W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
DDI1	YER143W	YOL057W	Q08225	711 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDI1	YER143W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
DDI1	YER143W	RAD2	P07276	1031 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDI1	YER143W	RAD4	P14736	754 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDI1	YER143W	RMT2	Q03305	412 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDI1	YER143W	LAM6	Q08001	693 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDI1	YER143W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
DDI1	YER143W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.05	□□□□□ -0.64	not detected
DDI1	YER143W	YDR306C	Q06640	478 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDI1	YER143W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
DDI1	YER143W	ZDS2	P54786	942 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDI1	YER143W	YPP1	P46951	817 aa		11.03	□□□□□ -0.64
DDI1	YER143W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
DDI1	YER143W	MRM1	P25270	412 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	POL32	P47110	350 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	YGR122W	P53272	402 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	CSI1	Q04368	295 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.4 ms