RNA–Protein interactions for RNA: YBL048W

RRT1, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene RRT1, Length 312 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT1YBL048W AIM7Q12156 149 aa7.8□□□□□ -1.16
RRT1YBL048W CAF120P53836 1060 aa7.78□□□□□ -1.16
RRT1YBL048W YBL086CP38177 466 aa7.77□□□□□ -1.17
RRT1YBL048W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RRT1YBL048W EMW1P42842 904 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RRT1YBL048W TY1A-BLQ12266 440 aa7.73□□□□□ -1.17
RRT1YBL048W ARG82P07250 355 aa7.72□□□□□ -1.17
RRT1YBL048W MIP1P15801 1254 aa7.72□□□□□ -1.17
RRT1YBL048W AAD14P42884 376 aa7.72□□□□□ -1.17
RRT1YBL048W SCW11P53189 542 aa7.72□□□□□ -1.17
RRT1YBL048W CSN12P47130 423 aa7.71□□□□□ -1.18
RRT1YBL048W ARG8P18544 423 aa7.7□□□□□ -1.18
RRT1YBL048W YIR007WP40566 764 aa7.7□□□□□ -1.18
RRT1YBL048W LSC2P53312 427 aa7.7□□□□□ -1.18
RRT1YBL048W FIG4P42837 879 aa7.69□□□□□ -1.18
RRT1YBL048W APP1P53933 587 aa7.69□□□□□ -1.18
RRT1YBL048W ITT1Q04638 464 aa7.69□□□□□ -1.18
RRT1YBL048W UBP2Q01476 1272 aa7.67□□□□□ -1.18
RRT1YBL048W TRK2P28584 889 aa7.66□□□□□ -1.18
RRT1YBL048W YJR098CP47139 656 aa7.66□□□□□ -1.18
RRT1YBL048W RAD59Q12223 238 aa7.65□□□□□ -1.18
RRT1YBL048W YGR035CP53222 116 aa7.64□□□□□ -1.19
RRT1YBL048W HPF1Q05164 967 aa7.63□□□□□ -1.19
RRT1YBL048W DLD1P32891 587 aa7.62□□□□□ -1.19
RRT1YBL048W YPR084WQ06821 456 aa7.62□□□□□ -1.19
RRT1YBL048W TCB1Q12466 1186 aa7.62□□□□□ -1.19
RRT1YBL048W MKS1P34072 584 aa7.6□□□□□ -1.19
RRT1YBL048W TEC1P18412 486 aa7.59□□□□□ -1.19
RRT1YBL048W OSH7P38755 437 aa7.59□□□□□ -1.19
RRT1YBL048W DFG5Q05031 458 aa7.58□□□□□ -1.2
RRT1YBL048W ROG3P43602 733 aa7.57□□□□□ -1.2
RRT1YBL048W MTC5Q03897 1148 aa7.57□□□□□ -1.2
RRT1YBL048W TY1A-MR1Q04215 440 aa7.57□□□□□ -1.2
RRT1YBL048W SSA2P10592 639 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RRT1YBL048W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RRT1YBL048W STE6P12866 1290 aa7.56□□□□□ -1.2
RRT1YBL048W FBP26P32604 452 aa7.56□□□□□ -1.2
RRT1YBL048W CCP1P00431 361 aa7.54□□□□□ -1.2
RRT1YBL048W BDS1Q08347 646 aa7.54□□□□□ -1.2
RRT1YBL048W KIN1P13185 1064 aa7.53□□□□□ -1.2
RRT1YBL048W GUT2P32191 649 aa7.52□□□□□ -1.21
RRT1YBL048W NAF1P53919 492 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RRT1YBL048W DPH6Q12429 685 aa7.52□□□□□ -1.21
RRT1YBL048W VTC4P47075 721 aa7.5□□□□□ -1.21
RRT1YBL048W CDC19P00549 500 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RRT1YBL048W ISU1Q03020 165 aa7.49□□□□□ -1.21
RRT1YBL048W FRA1Q07825 749 aa7.49□□□□□ -1.21
RRT1YBL048W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RRT1YBL048W LYS5P50113 272 aa7.48□□□□□ -1.21
RRT1YBL048W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RRT1YBL048W YPR204WQ08995 1032 aa7.48□□□□□ -1.21
RRT1YBL048W LEU3P08638 886 aa7.47□□□□□ -1.21
RRT1YBL048W ATG20Q07528 640 aa7.47□□□□□ -1.21
RRT1YBL048W STE20Q03497 939 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RRT1YBL048W DAL1P32375 460 aa7.44□□□□□ -1.22
RRT1YBL048W CSE4P36012 229 aa7.44□□□□□ -1.22
RRT1YBL048W ICP55P40051 511 aa7.44□□□□□ -1.22
RRT1YBL048W JJJ3P47138 172 aa7.43□□□□□ -1.22
RRT1YBL048W GUA1P38625 525 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RRT1YBL048W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RRT1YBL048W APL6P46682 809 aa7.4□□□□□ -1.22
RRT1YBL048W MRX12P47084 519 aa7.4□□□□□ -1.22
RRT1YBL048W RPN1P38764 993 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W DLD3P39976 496 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W CUZ1P53899 274 aa7.37□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W HPC2Q01448 625 aa7.37□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W WTM2Q12206 467 aa7.36□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W PHM7Q12252 991 aa7.36□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W SSN3P39073 555 aa7.35□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W EMP47P43555 445 aa7.35□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W MSN5P52918 1224 aa7.35□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W MCM16Q12262 181 aa7.35□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W SLA1P32790 1244 aa7.34□□□□□ -1.23
RRT1YBL048W MDJ1P35191 511 aa7.33□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W UBP15P50101 1230 aa7.32□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W ISF1P32488 338 aa7.31□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W YBL036CP38197 257 aa7.31□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W UTR2P32623 467 aa7.3□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W CEM1P39525 442 aa7.3□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W YFL066CP43538 392 aa7.3□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W TY1A-DR3Q12441 440 aa7.3□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W DIT1P21623 536 aa7.29□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W HAL5P38970 855 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W LSB3P43603 459 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W SYT1Q06836 1226 aa7.29□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W DAT1P13483 248 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RRT1YBL048W AI1P03875 834 aa7.27□□□□□ -1.25
RRT1YBL048W NSG2P53898 299 aa7.27□□□□□ -1.25
RRT1YBL048W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RRT1YBL048W BRL1P38770 471 aa7.26□□□□□ -1.25
RRT1YBL048W TFB3Q03290 321 aa7.26□□□□□ -1.25
RRT1YBL048W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RRT1YBL048W THI72Q08579 599 aa7.26□□□□□ -1.25
RRT1YBL048W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa7.26□□□□□ -1.25
RRT1YBL048W TBS1P38114 1094 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15 ms