RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA MMP1Q12372 583 aa6.3□□□□□ -1.4
15S_rRNA15S_rRNA BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data6.29□□□□□ -1.4not detected
15S_rRNA15S_rRNA NUP85P46673 744 aa6.28□□□□□ -1.4
15S_rRNA15S_rRNA TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
15S_rRNA15S_rRNA ESS1P22696 170 aa6.28□□□□□ -1.4
15S_rRNA15S_rRNA KTR1P27810 393 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA GLN1P32288 370 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA YJU3P28321 313 aa6.25□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA GLY1P37303 387 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA PHM7Q12252 991 aa6.25□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA SCW11P53189 542 aa6.25□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA MIP1P15801 1254 aa6.24□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA AIM7Q12156 149 aa6.24□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA LEU3P08638 886 aa6.23□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA ITT1Q04638 464 aa6.23□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-BLQ12266 440 aa6.23□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA VAC17P25591 423 aa6.22□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA MDJ1P35191 511 aa6.22□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA RTT106P40161 455 aa6.22□□□□□ -1.41
15S_rRNA15S_rRNA RSC30P38781 883 aa6.21□□□□□ -1.42
15S_rRNA15S_rRNA ARG82P07250 355 aa6.2□□□□□ -1.42
15S_rRNA15S_rRNA APP1P53933 587 aa6.2□□□□□ -1.42
15S_rRNA15S_rRNA YBL086CP38177 466 aa6.19□□□□□ -1.42
15S_rRNA15S_rRNA AAD14P42884 376 aa6.19□□□□□ -1.42
15S_rRNA15S_rRNA LSC2P53312 427 aa6.19□□□□□ -1.42
15S_rRNA15S_rRNA UBP2Q01476 1272 aa6.18□□□□□ -1.42
15S_rRNA15S_rRNA PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
15S_rRNA15S_rRNA DLD1P32891 587 aa6.17□□□□□ -1.42
15S_rRNA15S_rRNA CSN12P47130 423 aa6.17□□□□□ -1.42
15S_rRNA15S_rRNA YJR098CP47139 656 aa6.14□□□□□ -1.43
15S_rRNA15S_rRNA TCB1Q12466 1186 aa6.14□□□□□ -1.43
15S_rRNA15S_rRNA EMW1P42842 904 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
15S_rRNA15S_rRNA ARG8P18544 423 aa6.13□□□□□ -1.43
15S_rRNA15S_rRNA KIN1P13185 1064 aa6.12□□□□□ -1.43
15S_rRNA15S_rRNA CCT8P47079 568 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
15S_rRNA15S_rRNA RAD59Q12223 238 aa6.11□□□□□ -1.43
15S_rRNA15S_rRNA DPH6Q12429 685 aa6.11□□□□□ -1.43
15S_rRNA15S_rRNA OSH7P38755 437 aa6.1□□□□□ -1.43
15S_rRNA15S_rRNA LEO1P38439 464 aa6.09□□□□□ -1.43
15S_rRNA15S_rRNA FIG4P42837 879 aa6.09□□□□□ -1.43
15S_rRNA15S_rRNA ROG3P43602 733 aa6.09□□□□□ -1.43
15S_rRNA15S_rRNA SBP1P10080 294 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
15S_rRNA15S_rRNA NSG2P53898 299 aa6.08□□□□□ -1.44
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-MR1Q04215 440 aa6.08□□□□□ -1.44
15S_rRNA15S_rRNA RPN1P38764 993 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
15S_rRNA15S_rRNA DFG5Q05031 458 aa6.07□□□□□ -1.44
15S_rRNA15S_rRNA MKS1P34072 584 aa6.07□□□□□ -1.44
15S_rRNA15S_rRNA CCP1P00431 361 aa6.05□□□□□ -1.44
15S_rRNA15S_rRNA GUA1P38625 525 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
15S_rRNA15S_rRNA BDS1Q08347 646 aa6.03□□□□□ -1.44
15S_rRNA15S_rRNA SSA2P10592 639 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
15S_rRNA15S_rRNA YPR084WQ06821 456 aa6.02□□□□□ -1.45
15S_rRNA15S_rRNA TEC1P18412 486 aa6□□□□□ -1.45
15S_rRNA15S_rRNA LYS5P50113 272 aa6□□□□□ -1.45
15S_rRNA15S_rRNA NAM8Q00539 523 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
15S_rRNA15S_rRNA MAK16P10962 306 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
15S_rRNA15S_rRNA FBP26P32604 452 aa5.99□□□□□ -1.45
15S_rRNA15S_rRNA THI72Q08579 599 aa5.99□□□□□ -1.45
15S_rRNA15S_rRNA STE6P12866 1290 aa5.98□□□□□ -1.45
15S_rRNA15S_rRNA CDC19P00549 500 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
15S_rRNA15S_rRNA JJJ3P47138 172 aa5.95□□□□□ -1.46
15S_rRNA15S_rRNA YFL066CP43538 392 aa5.93□□□□□ -1.46
15S_rRNA15S_rRNA ISU1Q03020 165 aa5.93□□□□□ -1.46
15S_rRNA15S_rRNA ATG20Q07528 640 aa5.93□□□□□ -1.46
15S_rRNA15S_rRNA GUT2P32191 649 aa5.92□□□□□ -1.46
15S_rRNA15S_rRNA NAF1P53919 492 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
15S_rRNA15S_rRNA HPC2Q01448 625 aa5.92□□□□□ -1.46
15S_rRNA15S_rRNA DAL1P32375 460 aa5.92□□□□□ -1.46
15S_rRNA15S_rRNA CUZ1P53899 274 aa5.92□□□□□ -1.46
15S_rRNA15S_rRNA PKC1P24583 1151 aa5.91□□□□□ -1.46
15S_rRNA15S_rRNA VTC4P47075 721 aa5.91□□□□□ -1.46
15S_rRNA15S_rRNA TFB3Q03290 321 aa5.91□□□□□ -1.46
15S_rRNA15S_rRNA FRA1Q07825 749 aa5.91□□□□□ -1.46
15S_rRNA15S_rRNA CSE4P36012 229 aa5.89□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA YDJ1P25491 409 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA ISF1P32488 338 aa5.88□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA YBL036CP38197 257 aa5.88□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA STE20Q03497 939 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA DLD3P39976 496 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA MCM16Q12262 181 aa5.88□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA YPR053CQ6Q5F3 151 aa5.88□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA AI1P03875 834 aa5.87□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA CEM1P39525 442 aa5.87□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA BRL1P38770 471 aa5.86□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA EMP47P43555 445 aa5.86□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA BIO2P32451 375 aa5.85□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA APL6P46682 809 aa5.85□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA SPT5P27692 1063 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
15S_rRNA15S_rRNA RPP2BP02400 110 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
15S_rRNA15S_rRNA SSN3P39073 555 aa5.83□□□□□ -1.48
15S_rRNA15S_rRNA DAT1P13483 248 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
15S_rRNA15S_rRNA ISR1Q06098 443 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
15S_rRNA15S_rRNA WTM2Q12206 467 aa5.82□□□□□ -1.48
15S_rRNA15S_rRNA DIT1P21623 536 aa5.81□□□□□ -1.48
15S_rRNA15S_rRNA SLA1P32790 1244 aa5.81□□□□□ -1.48
15S_rRNA15S_rRNA UBP15P50101 1230 aa5.81□□□□□ -1.48
15S_rRNA15S_rRNA ADE12P80210 433 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
15S_rRNA15S_rRNA SYT1Q06836 1226 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 62.5 ms