RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeastyeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1YOL013C RVB1Q03940 463 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C BNA7Q04066 261 aa3.01□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C UBX2Q04228 584 aa3.01□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C YLR283WQ05867 314 aa3.01□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C GMC2Q06201 188 aa3.01□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C PBP4Q07362 185 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SHS1Q07657 551 aa3.01□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SAM4Q08985 325 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C GET4Q12125 312 aa3.01□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C MSH5Q12175 901 aa3.01□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SIA1Q12212 622 aa3.01□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C RRI1Q12468 440 aa3.01□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C YOS9Q99220 542 aa3.01□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C RPO21P04050 1733 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C YBT1P32386 1661 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C CDC33P07260 213 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C COQ1P18900 473 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SNC1P31109 117 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C ATO2P32907 282 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C PRS4P38063 326 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C RTC3P38804 111 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C PFS1P38872 237 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data3□□□□□ -1.93 RIP-Chip
HRD1YOL013C YCH1P42937 148 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SEH1P53011 349 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C PXR1P53335 271 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C BET4Q00618 327 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C CAC2Q04199 468 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C ARP10Q04549 284 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C GAT3Q07928 141 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SRL1Q08673 210 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SRL2Q12020 392 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C TIP41Q12199 356 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SET6Q12529 373 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C YBL111CQ3E7Y5 667 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C DET1Q99288 334 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C VTH1P40438 1549 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C VTH2P40890 1549 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C YRF1-1P0CX20 1796 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C YRF1-5P0CX21 1796 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C YRF1-8P0CX22 1796 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C RAD9P14737 1309 aa3□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C ZRC1P20107 442 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C PPA2P28239 310 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C VMA5P31412 392 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C MEI5P32489 222 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SKT5P34226 696 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C YBR056WP38081 501 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C IST2P38250 946 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C DHH1P39517 506 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SHO1P40073 367 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C AGP3P43548 558 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C OKP1P53298 406 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C YPL080CQ02826 108 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C OST6Q03723 332 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SNA4Q07549 140 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C REX4Q08237 289 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C TY3B-GQ99315 1547 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SMC4Q12267 1418 aa2.99□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C NHP6BP11633 99 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C TCP1P12612 559 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C HEM15P16622 393 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C PUT3P25502 979 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C COX13P32799 129 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C CBT1P36038 271 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C MRPL10P36520 322 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C RIB1P38066 345 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C OSH3P38713 996 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SMF2P38778 549 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SAD1P43589 448 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C MRX5P47007 382 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C YPT11P48559 417 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C AZR1P50080 613 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C TAF6P53040 516 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C EFM5P53200 248 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C LST7P53237 242 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C MKC7P53379 596 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C CUS2P53830 285 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C MTQ1P53944 314 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C CDC14Q00684 551 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C HER2Q03557 464 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SWF1Q04629 336 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C YOR387CQ08910 206 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C GRE1Q08969 168 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C SLF1Q12034 447 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C BSC1Q12140 328 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C MYO4P32492 1471 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C THP2O13539 261 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C MATALPHA2P0CY08 210 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C HMLALPHA2P0CY09 210 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C VPS1P21576 704 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C YCR007CP25354 239 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C LSB5P25369 354 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C MKK1P32490 508 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C PTR2P32901 601 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C FRE2P36033 711 aa2.98□□□□□ -1.93
HRD1YOL013C RIM2P38127 377 aa2.98□□□□□ -1.93
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