RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	ZRT3	P34240	503 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	ZIM17	P42844	174 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	RTT102	P53330	157 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	INP1	Q03694	420 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	TRM82	Q03774	444 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	DXO1	Q06349	442 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	MMT2	Q08970	484 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YPL264C	Q08980	353 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	SCM3	Q12334	223 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	RPC53	P25441	422 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	PAC11	P40960	533 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	ASG7	P46993	209 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	SHE4	P51534	789 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YGR111W	P53265	400 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YPL080C	Q02826	108 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YPL113C	Q02961	396 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	ERO1	Q03103	563 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	GMC1	Q04399	608 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	NDL1	Q06568	189 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	PDX1	P16451	410 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YKR015C	P36111	568 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YKR032W	P36127	104 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	MNL1	P38888	796 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	MOB2	P43563	287 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YFR045W	P43617	309 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	TPC1	P53257	314 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	VPS72	Q03388	795 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YMR010W	Q03687	405 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	TAF10	Q12030	206 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	FAR1	P21268	830 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	ATG7	P38862	630 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YER188W	P40103	239 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YCH1	P42937	148 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YFR018C	P43599	363 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	CDD1	Q06549	142 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	IPK1	Q06667	281 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YPR078C	Q06813	372 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	SHS1	Q07657	551 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	PLB3	Q08108	686 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	ALE1	Q08548	619 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YPR063C	Q12160	140 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	GPM3	Q12326	303 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RPN6	Q12377	434 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	INH1	P01097	85 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	PDE2	P06776	526 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
BLI1	YKL061W	MRPL8	P22353	238 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	URA10	P30402	227 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	VAM7	P32912	316 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RCK1	P38622	512 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	MLH1	P38920	769 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	LCB2	P40970	561 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	EPL1	P43572	832 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	MNN5	P46982	586 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	CAX4	P53223	239 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	FMP48	P53233	369 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YDR541C	Q03049	344 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	ARR1	Q06596	294 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YOL075C	Q08234	1294 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	AAD15	Q08361	143 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	DCI1	Q08558	271 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	UBA3	Q99344	299 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	CTA1	P15202	515 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	INO2	P26798	304 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RPN12	P32496	274 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	LTV1	P34078	463 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	IST2	P38250	946 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	EFM1	P38732	585 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	DSE1	P40077	573 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RET3	P53600	189 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	MIM1	Q08176	113 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	FEX1	Q08913	375 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	FEX2	Q08991	375 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	VPS63	O13549	108 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	CDC42	P19073	191 aa		0.43	□□□□□ -2.34

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