RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	RIB5	P38145	238 aa		4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	POP1	P41812	875 aa		4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	TRS85	P46944	698 aa		4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	TIS11	P47977	285 aa		4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	ERG5	P54781	538 aa		4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	APC9	Q12107	265 aa		4.09	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	AI3	P03877	415 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SNF3	P10870	884 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	URA6	P15700	204 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	EHD3	P28817	500 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	VAM7	P32912	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	PPZ2	P33329	710 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	RCK2	P38623	610 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YFL040W	P43562	540 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SFH5	P47008	294 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	VPS62	P53285	467 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	RCF2	P53721	224 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YPL080C	Q02826	108 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SNO1	Q03144	224 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	VBA1	Q04301	562 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	ERP3	Q12403	225 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	ARP6	Q12509	438 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YCR102C	P25608	368 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SKN1	P33336	771 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	CLG1	P35190	452 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	MCH2	P36032	473 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YBR053C	P38235	358 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	DER1	P38307	211 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YAL037W	P39728	267 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	LAS21	P40367	830 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	BMT5	P40493	336 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YGL235W	P53071	178 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YGL204C	P53089	101 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	BUD32	P53323	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	MSS11	Q03825	758 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YOL019W	Q08157	551 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	CPT1	P17898	393 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	TYR1	P20049	452 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	KIN3	P22209	435 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	NUP2	P32499	720 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	ECM15	P35195	104 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	FLO10	P36170	1169 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SHO1	P40073	367 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	COX15	P40086	486 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	DDI1	P40087	428 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	IRC24	P40580	263 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	IDP2	P41939	412 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	APS3	P47064	194 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	BUD4	P47136	1447 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	NBP35	P52920	328 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YNR066C	P53752	436 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	RIF2	Q06208	395 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	RSA1	Q08932	381 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SET6	Q12529	373 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	STE4	P18851	423 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	MBR1	P23493	339 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	ITR2	P30606	609 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YKL187C	P34231	750 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	CYC2	P38909	366 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SHC1	P39000	512 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	PHO90	P39535	881 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SCW11	P53189	542 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	PLM2	Q04383	521 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	EMP46	Q12396	444 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	SIR3	P06701	978 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	CDC6	P09119	513 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	UBC8	P28263	218 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	ECM8	P38246	354 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	IST2	P38250	946 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	MET30	P39014	640 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IKS1	YJL057C	CIN5	P40917	295 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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