RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C ALP1P38971 573 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C FLC2P39719 783 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C GCV3P39726 170 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SPO73P40031 143 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C PRE6P40303 254 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C BMT5P40493 336 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ICE2P40499 491 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C GLC8P41818 229 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YFL040WP43562 540 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C PTR3P43606 678 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SPO74P45819 413 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C DLD2P46681 530 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C NIT2P47016 307 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C DAN1P47178 298 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C MRX6P48564 524 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C PHB2P50085 310 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C PHO23P50947 330 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C COS10P52924 374 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YGL159WP53110 370 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SLX9P53251 210 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SHY1P53266 389 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SYF2P53277 215 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C HOL1P53389 586 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RPT4P53549 437 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C MPA43P53583 542 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C FPK1P53739 893 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SAM50P53969 484 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SAE3P89114 91 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C DIG2Q03373 323 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C OYE2Q03558 400 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YMR155WQ03795 547 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C NHX1Q04121 633 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C MCA1Q08601 432 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C FDH1Q08911 376 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YLL056CQ12177 298 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C WTM1Q12363 437 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YDL199CQ12407 687 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C MRX4Q12467 430 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C CTF3Q12748 733 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YPR014CQ6B0W2 109 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C FLO1P32768 1537 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ADH2P00331 348 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C PRC1P00729 532 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C HXK2P04807 486 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RPL9AP05738 191 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SGA1P08019 549 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C NHP6AP11632 93 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SPO7P18410 259 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ZRC1P20107 442 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TRX2P22803 104 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C AGP1P25376 633 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C HOM6P31116 359 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SOF1P33750 489 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TSA1P34760 196 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SRY1P36007 326 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C FLO10P36170 1169 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YBR063CP38083 404 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C HSL7P38274 827 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C CHS7P38843 316 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C FET3P38993 636 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C HPA3P39979 161 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C COG3P40094 801 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C PCL7P40186 285 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C KHA1P40309 873 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C PAN6P40459 309 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C FMC1P40491 155 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YFL052WP43551 465 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YJR012CP47087 207 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YJR056CP47115 236 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C HMS2P47175 358 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C HXT16P47185 567 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ASK10P48361 1146 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SOL1P50278 321 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RPL9BP51401 191 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C AIF1P52923 378 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SDT1P53078 280 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C PRM8P53174 237 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TIM21P53220 239 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YGR053CP53234 283 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C COQ6P53318 479 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C GPI15P53961 229 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ERV25P54837 211 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C LSM3P57743 89 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C CYT2Q00873 224 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C MRP51Q02950 344 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RSM10Q03201 203 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C GAS3Q03655 524 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SPC19Q03954 165 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C CTK1Q03957 528 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C AGE1Q04412 482 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C AIM33Q04516 312 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YDR124WQ04608 324 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YDR286CQ05530 114 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C INM2Q05533 292 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C MSC3Q05812 728 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ECM7Q06200 448 aa3.29□□□□□ -1.88
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