RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W GRX8Q05926 109 aa5.16□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W YLR345WQ06137 509 aa5.16□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data5.16□□□□□ -1.58 RIP-Chip
VHS1YDR247W JLP1Q12358 412 aa5.16□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W YPL119C-AQ3E751 87 aa5.16□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W MHF2Q3E829 80 aa5.16□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W RIB3Q99258 208 aa5.16□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W HIS1P00498 297 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W ATP1P07251 545 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W GIT1P25346 518 aa5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W YCR099CP25657 155 aa5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W MIA40P36046 403 aa5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W UTP30P36144 274 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W RPL32P38061 130 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W SHE3P38272 425 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W FHL1P39521 936 aa5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W EDC3P39998 551 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W RGI1P40043 161 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W FET5P43561 622 aa5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W IRC7P43623 340 aa5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W DLD2P46681 530 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W SNG1P46950 547 aa5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W NET1P47035 1189 aa5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W HOC1P47124 396 aa5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W UBP8P50102 471 aa5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W AIM32Q04689 311 aa5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W VTA1Q06263 330 aa5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W PST2Q12335 198 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W AFI1Q99222 893 aa5.15□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W AMD1P15274 810 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W RPL24BP24000 155 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W RHB1P25378 209 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W HSP30P25619 332 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W ARP1P38696 384 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W PAC11P40960 533 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W ARO8P53090 500 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W COP1P53622 1201 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W RSM23Q01163 450 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W SPP2Q02521 185 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W NUP100Q02629 959 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W YMR010WQ03687 405 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W YDR124WQ04608 324 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W SWF1Q04629 336 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W NEJ1Q06148 342 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W GLE1Q12315 538 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W RPN6Q12377 434 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa5.14□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W RPL3P14126 387 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W CLN1P20437 546 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W NUP1P20676 1076 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W DBF2P22204 572 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W CHA1P25379 360 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W RPS1AP33442 255 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W APE3P37302 537 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W RIB1P38066 345 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W GPX2P38143 162 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W FMP23P38231 175 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W EFM1P38732 585 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W YHK8P38776 514 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W AYR1P40471 297 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W GTO1P48239 356 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W LYS20P48570 428 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W YPT32P51996 222 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W ART5P53244 586 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W STP1Q00947 519 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W SMA1Q02651 245 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W MSC1Q03104 513 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W SYO1Q07395 620 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W GSH2Q08220 491 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W FRE3Q08905 711 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W PGC1Q08959 321 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W RBD2Q12270 262 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W ICT1Q12385 394 aa5.13□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W POX1P13711 748 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W GRR1P24814 1151 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W ARO7P32178 256 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W SDH3P33421 198 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W DDI1P40087 428 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W COG3P40094 801 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W SOK1P40317 901 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W BIO3P50277 480 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W YGR266WP53326 701 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W NUP49Q02199 472 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W MAK3Q03503 176 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W EMI1Q04406 187 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W MFG1Q07684 458 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W LDB18Q07887 179 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W THP1Q08231 455 aa5.12□□□□□ -1.59
VHS1YDR247W PFA4Q12006 378 aa5.12□□□□□ -1.59
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