RNA–Protein interactions for RNA: YBR237W

PRP5, Transcript of RNA helicase in the DEAD-box family, yeast

Gene PRP5, Length 2,550 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP5	YBR237W	SMF2	P38778	549 aa		0.56	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	LCB2	P40970	561 aa		0.56	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	UFE1	P41834	346 aa		0.56	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YJR054W	P47114	497 aa		0.56	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	PMT5	P52867	743 aa		0.56	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	CAX4	P53223	239 aa		0.56	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	ZRG17	P53735	605 aa		0.56	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	COS1	P53822	381 aa		0.56	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	SED5	Q01590	340 aa		0.56	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	MEH1	Q02205	184 aa		0.56	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	RMI1	Q02685	241 aa		0.56	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YKR032W	P36127	104 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	SHE1	P38200	338 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	PES4	P39684	611 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	BDH1	P39714	382 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	MIC19	P43594	170 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YGL118C	P53132	145 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	RRN9	P53437	365 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	PRM1	P53835	661 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	GMC1	Q04399	608 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	NDL1	Q06568	189 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	GAT3	Q07928	141 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	APC5	Q08683	685 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YDL211C	Q12121	372 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	RGS2	Q99188	309 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	ISN1	Q99312	450 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	FSH3	Q99369	266 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	CUP2	P15315	225 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	CPT1	P17898	393 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	MDL1	P33310	695 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	TAE1	P38340	232 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	KEG1	P43614	200 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YGR016W	P53209	190 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	INP1	Q03694	420 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	CSI1	Q04368	295 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YFH1	Q07540	174 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	IES3	Q12345	250 aa		0.55	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	RBK1	P25332	333 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	HMX1	P32339	317 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YMR262W	P38430	313 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	ECM14	P38836	430 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	ECO1	P43605	281 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YJL144W	P47009	104 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YML6	P51998	286 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	SMP3	Q04174	516 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YLL053C	P0CD98	152 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	MAS1	P10507	462 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	SWE1	P32944	819 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	CSE1	P33307	960 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.54	□□□□□ -2.32	not detected
PRP5	YBR237W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	EFM4	P40516	257 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YFR018C	P43599	363 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	TOS2	P50078	622 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	NAS6	P50086	228 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	EOS1	P53938	366 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	TRM82	Q03774	444 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	AIM33	Q04516	312 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	MCT1	Q12283	360 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	TFC7	Q12415	435 aa		0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	ERD1	P16151	362 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	MEI5	P32489	222 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	TKL2	P33315	681 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	SRB2	P34162	210 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	ZRT3	P34240	503 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	CTM1	P38818	585 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	HEM14	P40012	539 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	COS4	P43542	379 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	SHE4	P51534	789 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	FMP48	P53233	369 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	LST7	P53237	242 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YPL080C	Q02826	108 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	ALE1	Q08548	619 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	YPR063C	Q12160	140 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	FRE8	Q12209	686 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	MRX4	Q12467	430 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	DAL5	P15365	543 aa		0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
PRP5	YBR237W	PSO2	P30620	661 aa		0.53	□□□□□ -2.32

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