RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	LSB5	P25369	354 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	APL3	P38065	1025 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	SDS3	P40505	327 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	SNZ3	P43545	298 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	HIT1	P46973	164 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	TPN1	P53099	579 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	SOL4	P53315	255 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YNR048W	P53740	393 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	SNZ2	P53824	298 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	MUK1	Q02866	612 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	MRP51	Q02950	344 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	SMP3	Q04174	516 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	ARP10	Q04549	284 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	MRPL35	Q06678	367 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	THI3	Q07471	609 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	BSC1	Q12140	328 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YDL009C	Q12210	107 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	SIA1	Q12212	622 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YDL199C	Q12407	687 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	ERG11	P10614	530 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	CTS1	P29029	562 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	ERG9	P29704	444 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	DEP1	P31385	405 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	RSM25	P40496	264 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	IBA57	P47158	497 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YNL146W	P53906	100 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	KIN4	Q01919	800 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	GGA1	Q06336	557 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	TAZ1	Q06510	381 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	IZH4	Q99393	312 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	RAD9	P14737	1309 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	RAD7	P06779	565 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	POF1	P25576	258 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	MIC12	P38341	106 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	HEM14	P40012	539 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	PTR3	P43606	678 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	VAC7	P53950	1165 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	RRN11	Q04712	507 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	FAR8	Q05040	523 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YPL199C	Q08954	240 aa		2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AI2	Q0055	SSO1	P32867	290 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	PPZ2	P33329	710 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	CHK1	P38147	527 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	ECM8	P38246	354 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YNL194C	P40169	301 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	SUR7	P54003	302 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	CMC2	Q3E7A4	109 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	TUS1	Q06412	1307 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	REP1	P03871	373 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.54	□□□□□ -2	not detected
AI2	Q0055	YMR085W	P0CF18	432 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	ASP3-2	P0CX77	362 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	ASP3-3	P0CX78	362 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	ASP3-4	P0CX79	362 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YER190C-B	P0CX94	160 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YMR31	P19955	123 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YCR006C	P25350	157 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YBR062C	P38239	180 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YPC1	P38298	316 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	CHS7	P38843	316 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	UBC13	P52490	153 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	MAL13	P53338	473 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	OST6	Q03723	332 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	ARO80	Q04052	950 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	COQ10	Q08058	207 aa		2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AI2	Q0055	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
AI2	Q0055	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
AI2	Q0055	RCK1	P38622	512 aa		2.53	□□□□□ -2
AI2	Q0055	FAA2	P39518	744 aa		2.53	□□□□□ -2

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