RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	STP3	Q05937	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	SPO77	Q06134	477 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	ATG17	Q06410	417 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
TRM10	YOL093W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MMT2	Q08970	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RER1	P25560	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	IMG1	P25626	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	BET3	P36149	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RCY1	P39531	840 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	AIM2	P39721	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	APS3	P47064	194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	ASK10	P48361	1146 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	TWF1	P53250	332 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MSC1	Q03104	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RSC9	Q03124	581 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MRX4	Q12467	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	SKS1	Q12505	502 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	TIM9	O74700	87 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	UBC8	P28263	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YMC1	P32331	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	VPH2	P32341	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MKK1	P32490	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YOR062C	P36025	268 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	EXO84	P38261	753 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	TDA11	P38854	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	PZF1	P39933	429 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YEL020C	P39994	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
TRM10	YOL093W	BIT61	P47041	543 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MRK1	P50873	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	IGO1	P53897	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	DLT1	Q04216	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RSF1	Q05043	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	ARO10	Q06408	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	BSC6	Q08280	497 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	NKP1	Q12493	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	CAN1	P04817	590 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	CDC26	P14724	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	DAL82	P21705	255 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MRPS28	P21771	286 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	CTR86	P25355	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	POL4	P25615	582 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	SPC42	P36094	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	SIC1	P38634	284 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YLF2	P38746	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RPP1	P38786	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	SWD1	P39706	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	STE24	P47154	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	TRM9	P49957	279 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	FHN1	P53279	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RNH70	P53331	553 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	COG5	P53951	403 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	SPR6	Q01684	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	HOT1	Q03213	719 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	VID22	Q05934	901 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	ACF2	Q12168	779 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MRPL6	P32904	214 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	UTH1	P36135	365 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	FES1	P38260	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	VPS52	P39904	641 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	VRG4	P40107	337 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MPM1	P40364	252 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YIL086C	P40503	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	MAL11	P53048	616 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	YGR079W	P53249	370 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	SWP1	Q02795	286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRM10	YOL093W	NAT4	Q04751	285 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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