RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W NOP9P47077 666 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W IST1P53843 298 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W CSI1Q04368 295 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SOR2Q07786 357 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W USB1Q12208 290 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YOL107WQ12239 342 aa2.65□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MRPL25P23369 157 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MRPL4P36517 319 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ASC1P38011 319 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YBR056WP38081 501 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PAC11P40960 533 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W AIM22P47051 409 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PET130P47065 347 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YGR126WP53274 230 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RET3P53600 189 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YLR460CP54007 376 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W FIN1Q03898 291 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W AIM33Q04516 312 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RRG8Q06109 277 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W TPK2P06245 380 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RPS19AP07280 144 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MSI1P13712 422 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W VPS34P22543 875 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RRT2P38332 387 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W DSE1P40077 573 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MIX14Q04341 121 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SUE1Q06524 206 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W BTS1Q12051 335 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RBD2Q12270 262 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ERG11P10614 530 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SAR1P20606 190 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PET18P25362 215 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MRE11P32829 692 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W BUR6P40096 142 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W UTP25P40498 721 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MET28P40573 187 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W GCN20P43535 752 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RHO5P53879 331 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W UFO1Q04511 668 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ARR1Q06596 294 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W CDC45Q08032 650 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W CSI2Q08054 341 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SPO7P18410 259 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W URA7P28274 579 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W AIM26P32858 118 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YKT6P36015 200 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W FHL1P39521 936 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W FAR3P46671 204 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YGR149WP48236 432 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W AMA1P50082 593 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W EFM5P53200 248 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W NRG1Q03125 231 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ABZ2Q03266 374 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W BUR2Q05949 395 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W AIM6Q07716 390 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ADF1Q2V2Q1 113 aa2.64□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SPS4P09937 338 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SLM4P38247 162 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data2.63□□□□□ -1.99not detected
SIN3YOL004W SEN34P39707 275 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RSM27P53305 110 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W NSG2P53898 299 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W GTO3Q04806 366 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W FRE3Q08905 711 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W GET4Q12125 312 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RAD10P06838 210 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W CHS1P08004 1131 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W CDC42P19073 191 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W DCC1P25559 380 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MGR1P25573 417 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RAD14P28519 371 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ITR2P30606 609 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SRB4P32569 687 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PRX1P34227 261 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W CBP4P37267 147 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MSE1P48525 536 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SCW11P53189 542 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W DRN1P53255 507 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W GRX3Q03835 250 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YPL216WQ08964 1102 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YPK1P12688 680 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ATP11P32453 318 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SSO2P39926 295 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W IDP2P41939 412 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MPS2P53159 387 aa2.63□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ERG13P54839 491 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
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