RNA–Protein interactions for RNA: YMR228W

MTF1, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase specificity factor, yeast

Gene MTF1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTF1	YMR228W	GWT1	P47026	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YGL185C	P53100	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	ESBP6	P53918	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	BET4	Q00618	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	TLG1	Q03322	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	SMP3	Q04174	516 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	BUR2	Q05949	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	TIM18	Q08749	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	HEM2	P05373	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	CKI1	P20485	582 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YCL068C	P25593	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YUR1	P26725	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	NTG1	P31378	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	SCS3	P53012	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YNL260C	P53846	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YML122C	Q03207	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	ARV1	Q06541	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	SHS1	Q07657	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	GEP3	Q08622	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	NCA2	Q12374	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	UNG1	P12887	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	AZF1	P41696	914 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	COQ11	Q05892	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	APC5	Q08683	685 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YOP1	Q12402	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YPR1	Q12458	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	MRP4	P32902	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	VAM7	P32912	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YKL097C	P34245	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YPT53	P36019	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	SHO1	P40073	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	POP6	P53218	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	SPR6	Q01684	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RRN11	Q04712	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	BCP1	Q06338	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	MED4	Q12343	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	FMP16	Q12497	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RSR1	P13856	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	MXR2	P25566	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	HXT1	P32465	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	SPR1	P32603	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	ECT1	P33412	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RCY1	P39531	840 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YIR014W	P40570	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YFL040W	P43562	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	TOS2	P50078	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YGR168C	P53293	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	TOA2	P32774	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	MST28	P39552	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	SFH5	P47008	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	LSB1	P53281	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	NAT4	Q04751	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YAP7	Q08182	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	AFT2	Q08957	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
MTF1	YMR228W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	YEF1	P32622	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MTF1	YMR228W	MRPS5	P33759	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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