RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	MRPS9	P38120	278 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YHR177W	P38867	453 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	PFS1	P38872	237 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	TIM17	P39515	158 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	EPL1	P43572	832 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YPS5	P53057	165 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	MKC7	P53379	596 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	VHS1	Q03785	461 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YFH1	Q07540	174 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	PGC1	Q08959	321 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	QCR6	P00127	147 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	GIT1	P25346	518 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	GPI18	P38211	433 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	WSS1	P38838	269 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	IGD1	P43598	195 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	KTR6	P54070	446 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.32	□□□□□ -2.04	not detected
YLR224W	YLR224W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YDR061W	Q12298	539 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	MER1	P16523	270 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	CMK2	P22517	447 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	IME2	P32581	645 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	BMT2	P38278	337 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	SEO1	P39709	593 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	RTT105	P40063	208 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	SEC9	P40357	651 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YGL262W	P53054	175 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	VHT1	P53241	593 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.31	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	PSO2	P30620	661 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	SOL2	P37262	315 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YBL028C	P38202	106 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	PCL7	P40186	285 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	KEG1	P43614	200 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	PGU1	P47180	361 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	HST1	P53685	503 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	APJ1	P53940	528 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	ECM11	Q04110	302 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	RNH1	Q04740	348 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	MSC3	Q05812	728 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	ARV1	Q06541	321 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YPQ1	Q12010	308 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	SFM1	Q12314	213 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YDL012C	Q12489	107 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	ATG2	P53855	1592 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	MSP1	P28737	362 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	SMI1	P32566	505 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	RIB7	P33312	244 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	CIN2	P46670	268 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	RET3	P53600	189 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	VAC7	P53950	1165 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YPR078C	Q06813	372 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	MCH1	Q07376	486 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	SHS1	Q07657	551 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	GAT3	Q07928	141 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	PEX27	Q08580	376 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	REX3	Q12090	404 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YDL109C	Q12103	647 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	MCT1	Q12283	360 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	SKS1	Q12505	502 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	TOR1	P35169	2470 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	HEM4	P06174	275 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	MAS2	P11914	482 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	GRR1	P24814	1151 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	LDS1	P31379	325 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	MSK1	P32048	576 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	VAM7	P32912	316 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YSW1	P38280	609 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.28	□□□□□ -2.04	not detected
YLR224W	YLR224W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	2.28	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	MPS2	P53159	387 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	YGR018C	P53211	109 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	EOS1	P53938	366 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	NFI1	Q12216	726 aa		2.28	□□□□□ -2.04

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.1 ms