RNA–Protein interactions for RNA: YJR104C

SOD1, Transcript of Cytosolic copper-zinc superoxide dismutase, yeast

Gene SOD1, Length 465 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	YJR104C	MMS4	P38257	691 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	UIP3	P39547	235 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YEL076C	P39971	216 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ALG8	P40351	577 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	IRC24	P40580	263 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YGR201C	P42936	225 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ASG7	P46993	209 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CCC1	P47818	322 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PAC10	P48363	199 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TNA1	P53322	534 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MAL12	P53341	584 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SUN4	P53616	420 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	HCH1	P53834	153 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MRPL22	P53881	309 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NUP49	Q02199	472 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TRS130	Q03660	1102 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PEX12	Q04370	399 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SMA2	Q04658	369 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CSM3	Q04659	317 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YDR222W	Q04925	415 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	HOF1	Q05080	669 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PHO92	Q06390	306 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GRC3	Q07845	632 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PEX27	Q08580	376 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ESA1	Q08649	445 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	UAF30	Q08747	228 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YDR018C	Q12185	396 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	FYV7	Q12247	151 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YLR108C	Q12259	485 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RKM5	Q12367	367 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RTN2	Q12443	393 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	KCS1	Q12494	1050 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PHO5	P00635	467 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ATP4	P05626	244 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RHO2	P06781	192 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ERR1	P0CX10	437 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ERR2	P0CX11	437 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	REV1	P12689	985 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	DAL81	P21657	970 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CTS1	P29029	562 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ERG9	P29704	444 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RNP1	P32385	249 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ECT1	P33412	323 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	OAR1	P35731	278 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AIM29	P36154	155 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TAT1	P38085	619 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GEP4	P38812	185 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RBG1	P39729	369 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PCL6	P40038	420 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SCC4	P40090	624 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	IMA5	P40884	581 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AGX1	P43567	385 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PMT4	P46971	762 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PRY1	P47032	299 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SNN1	P48232	102 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	DIA3	P52290	468 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YGR168C	P53293	376 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PRM1	P53835	661 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	INN1	P53901	409 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YPL113C	Q02961	396 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	UGO1	Q03327	502 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MAK3	Q03503	176 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YMR209C	Q03648	457 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CAC2	Q04199	468 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TRM12	Q04235	462 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RTT103	Q05543	409 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RAD34	Q06665	692 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GUP2	Q08929	609 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ENV7	Q12003	364 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ATX2	Q12067	313 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SPC3	Q12133	184 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.34	□□□□□ -1.87	not detected
SOD1	YJR104C	YOR114W	Q12219	294 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LCB4	Q12246	624 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YLR046C	Q12253	270 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	FRE7	Q12333	620 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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