RNA–Protein interactions for RNA: YHR087W

RTC3, Transcript of Protein of unknown function involved in RNA metabolism, yeast

Gene RTC3, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC3	YHR087W	SUR1	P33300	382 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	GPX2	P38143	162 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	MBP1	P39678	833 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	ZRG8	P40021	1076 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	TIM54	P47045	478 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	RPA14	P50106	137 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	BUD17	P53727	317 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	MAK3	Q03503	176 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	ELP6	Q04868	273 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	STP3	Q05937	343 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YPQ2	Q06328	317 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YLR040C	Q07988	224 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	TPO4	Q12256	659 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	HFA1	P32874	2273 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	RPN13	O13563	156 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	ECM15	P35195	104 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	FCY21	P40039	528 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	AIM20	P40451	204 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	IDS2	P46958	469 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YJL055W	P47044	245 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	RIM21	P48565	533 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YKR011C	Q02209	353 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YOR365C	Q08844	703 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	TRA1	P38811	3744 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	HOP1	P20050	605 aa		14	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	NDC1	P32500	655 aa		14	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	SEC66	P33754	206 aa		14	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	TOD6	P34219	525 aa		14	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	FIN1	Q03898	291 aa		14	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	RSM24	Q03976	319 aa		14	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	VID22	Q05934	901 aa		14	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	CRT10	Q08226	957 aa		14	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	UIP4	Q08926	304 aa		14	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	NFT1	P0CE68	1218 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YOL162W	P0CF19	215 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	LYP1	P32487	611 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	PTR2	P32901	601 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	SEC61	P32915	480 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	BET3	P36149	193 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YHR035W	P38769	630 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	TOS2	P50078	622 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YGL101W	P53144	215 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	CPR8	P53728	308 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YDR541C	Q03049	344 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	URC2	Q04411	772 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	BNA5	Q05979	453 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YLR346C	Q06139	101 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YOR238W	Q08634	303 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	RCN2	Q12044	265 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	RIP1	P08067	215 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	STE4	P18851	423 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	PBN1	P25580	416 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	RIB7	P33312	244 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	VPS51	P36116	164 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	MNT4	P53745	580 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	ACF2	Q12168	779 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	IMG1	P25626	169 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	ORC2	P32833	620 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YPT7	P32939	208 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	NVJ1	P38881	321 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	SMK1	P41808	388 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	QRI7	P43122	407 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	COS10	P52924	374 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	OST6	Q03723	332 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YDR514C	Q04408	483 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	PCL9	Q12477	304 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	MET2	P08465	486 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	RAD51	P25454	400 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YCR100C	P25606	316 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	ARO7	P32178	256 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	YHR219W	P38900	624 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	SCW11	P53189	542 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	DIC1	Q06143	298 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	MLC2	Q06580	163 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	BRE4	Q07660	1125 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	SPC3	Q12133	184 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	LSO1	Q3E827	93 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RTC3	YHR087W	PET112	P33893	541 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	SPC19	Q03954	165 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	ARV1	Q06541	321 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	CWP1	P28319	239 aa		13.94	□□□□□ -0.18

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