RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	SPO22	P40511	975 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YIL029C	P40538	142 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	HXT14	P42833	540 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	TOS3	P43637	560 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SED5	Q01590	340 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YPL107W	Q02873	248 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ECM19	Q06011	112 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	OPY2	Q06810	360 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	DDC1	Q08949	612 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RCN2	Q12044	265 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YDR018C	Q12185	396 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	FLO11	P08640	1367 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.25	□□□□□ -2.37	not detected
CSE1	YGL238W	TOP1	P04786	769 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SPS4	P09937	338 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	NAM2	P11325	894 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RHB1	P25378	209 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	DBF4	P32325	704 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	TKL2	P33315	681 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	TIP20	P33891	701 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RRG9	P40156	214 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	UFE1	P41834	346 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	PHB2	P50085	310 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	KTR6	P54070	446 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	LOT6	Q07923	191 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SNF6	P18888	332 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	PRE8	P23639	250 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	GPI10	P30777	616 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SPO23	P33757	523 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ATG12	P38316	186 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	WSC4	P38739	605 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	EAF6	P47128	113 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	EFM3	P47163	339 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YGR015C	P53208	328 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RGM1	Q00453	211 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ATG16	Q03818	150 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YDR056C	Q12025	205 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	STE7	P06784	515 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	MIG1	P27705	504 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	IMP2'	P32351	346 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	CBP4	P37267	147 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	VHC1	P38329	1120 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	FCY21	P40039	528 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ESL1	P40456	1118 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YJR054W	P47114	497 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YLR177W	Q06251	628 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	MCH1	Q07376	486 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SLM3	Q12093	417 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	FOB1	O13329	566 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	UNG1	P12887	359 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ALG1	P16661	449 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	CLB1	P24868	471 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SMF1	P38925	575 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SHC1	P39000	512 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	MNN5	P46982	586 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YGL088W	P53151	121 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	TFC7	Q12415	435 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	CKA2	P19454	339 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	BEM1	P29366	551 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	PMT2	P31382	759 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ECM34	P38728	170 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RRT13	P40042	185 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	TPM2	P40414	161 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	COS5	P47187	383 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	NAS6	P50086	228 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	COS7	Q07788	383 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	VAM3	Q12241	283 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YCL042W	P25572	119 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	TFB1	P32776	642 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	STN1	P38960	494 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YIR035C	P40579	254 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	HAC1	P41546	238 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	TIM10	P87108	93 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	MSC3	Q05812	728 aa		0.23	□□□□□ -2.37

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